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标题: 求助gromacs里哪条指令可以在关掉gpu加速的情况下rerun重新生成能量文件 [打印本页]

作者
Author: one.piece 时间: 2020-3-5 12:34
标题: 求助gromacs里哪条指令可以在关掉gpu加速的情况下rerun重新生成能量文件
各位老师，各位大佬，感谢点击我的求助帖。
我最近在计算分子相互作用能，但是前辈说开着gpu加速跑出来的能量数据是有误的，让我关了gpu加速去rerun。所以我想问一下怎么才能在rereun时关掉gpu加速，谢谢大家。

作者
Author: mol 时间: 2020-3-5 14:28
我的理解可能需要编译一个cpu版

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-5 14:31
尝试mdrun时候-nb cpu
用CPU版也可以

作者
Author: one.piece 时间: 2020-3-5 15:51

mol 发表于 2020-3-5 14:28
我的理解可能需要编译一个cpu版

我考虑一下，谢谢啊

作者
Author: one.piece 时间: 2020-3-5 15:52

sobereva 发表于 2020-3-5 14:31
尝试mdrun时候-nb cpu
用CPU版也可以

谢谢sob老师，我去搞一下。

作者
Author: wuzhiyi 时间: 2020-3-5 19:48
本帖最后由 wuzhiyi 于 2020-3-6 17:16 编辑

GPU加速能量错误是怎么回事啊？愿闻其详，我一直都GPU加速跑rerun的而且我记得如果Gromacs如果在编译的时候没加GPU支持的话会导致rerun能量是错的
详情见https://redmine.gromacs.org/issues/3400

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