计算化学公社

标题: 对ORCA用户大幅节约Multiwfn做分子表面静电势分析耗时的方法 [打印本页]

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-3-6 05:47
标题: 对ORCA用户大幅节约Multiwfn做分子表面静电势分析耗时的方法
后记:此文的做法已经没有任何意义了,Multiwfn内部计算静电势的代码速度早已得到了巨大的提升,看《Multiwfn使用的高效的静电势算法的介绍文章已于PCCP期刊发表!》(http://sobereva.com/614)、《Multiwfn的计算静电势的内部代码速度得到了巨幅提升!》(http://sobereva.com/563)。



如《Multiwfn现已可以调用cubegen使静电势分析耗时有飞跃式的下降!》(http://sobereva.com/435)中所述,通过让Multiwfn调用Gaussian里的cubegen可以大幅节约Multiwfn做各种静电势分析的耗时,即便是ORCA用户也可以用此做法(把gbw/molden文件载入Multiwfn,用主功能100的子功能2导出成fch,再用fch作为输入文件)。但有的人被Gaussian给ban了,比如http://sobereva.com/wfnbbs/viewtopic.php?id=289里面那个人,或者因为各种原因用不了Gaussian。对这种情况,ORCA用户也可以利用ORCA自带的计算特定位置静电势值的orca_vpot工具来大幅节约Multiwfn分析分子表面静电势的耗时,具体过程在这里写了:http://sobereva.com/wfnbbs/viewtopic.php?id=292

对于def2-TZVP基组下的苯酚的分子表面静电势分析,使用这种做法可以节约耗时一个数量级以上,结果和使用Multiwfn内部代码算静电势的情况几乎没任何差异。

以后的版本Multiwfn会试图大幅提升静电势计算效率,届时可能就没必要再用这种做法了。

作者
Author:
zsu007    时间: 2020-3-6 10:53
社长威武!
作者
Author:
wuzhiyi    时间: 2020-3-6 17:09
在之前的帖子里http://bbs.keinsci.com/thread-16124-1-1.html#pid109587 提到如何要用MP2密度的话
需要 (, 下载次数 Times of downloads: 19) 想问一下要是用
orca_vpot h2o.gbw h2o.scfp surfptpos.txt out.txt
来生成ESP的话
是不是只要写%mp2 Density relaxed end
然后直接用gbw就行?

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-3-7 11:02
wuzhiyi 发表于 2020-3-6 17:09
在之前的帖子里http://bbs.keinsci.com/thread-16124-1-1.html#pid109587 提到如何要用MP2密度的话
需要 ...

我在http://sobereva.com/wfnbbs/viewtopic.php?pid=940的2L里给了个具体例子
作者
Author:
wuzhiyi    时间: 2020-3-7 18:18
sobereva 发表于 2020-3-7 11:02
我在http://sobereva.com/wfnbbs/viewtopic.php?pid=940的2L里给了个具体例子

谢谢sob老师 也不知道%mp2 Density relaxed end单独用有啥用
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-3-9 07:09
wuzhiyi 发表于 2020-3-7 18:18
谢谢sob老师 也不知道%mp2 Density relaxed end单独用有啥用

单独用的时候可以得到MP2自然轨道,用于在Multiwfn中做MP2级别的波函数分析。如果用Multiwfn内部代码算静电势的话,有这一个记录MP2自然轨道的文件就够了




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3