计算化学公社

标题: 求助：带电结构的结构优化应该怎么设置？ [打印本页]

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Author: gch123 时间: 2020-3-8 15:20
标题: 求助：带电结构的结构优化应该怎么设置？
请问一下各位老师，我要计算CH3CH2O-在表面上的吸附情况，首先进行CH3CH2O-的结构优化，用的CASTEP,在结构优化时前需要对这个结构设置总体电荷为-1吗？还是直接构建CH3CH2O结构进行结构优化？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-3-8 19:50
CASTEP一般而言是处理不好带电体系的，可以考虑加反电荷粒子比如H、Na等（当然是根据你实际体系而定），使得体系电中性。要么就别用CASTEP，比如QE这些能用Markov-Payne修正。

作者
Author: gch123 时间: 2020-3-8 21:55

卡开发发发表于 2020-3-8 19:50
CASTEP一般而言是处理不好带电体系的，可以考虑加反电荷粒子比如H、Na等（当然是根据你实际体系而定），使 ...

谢谢老师的解答，那vasp或者gaussian适合吗？另外，我计算的是乙醇的裂解过程，可以直接把优化好的乙醇分子删掉一个H之后，放在表面进行吸附计算，而不单独优化CH3CH2O-阴离子？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-3-8 23:05

gch123 发表于 2020-3-8 21:55
谢谢老师的解答，那vasp或者gaussian适合吗？另外，我计算的是乙醇的裂解过程，可以直接把优化好的乙醇分 ...

不涉及到周期边界的处理的话不用考虑电中性及相关修正，比如Gaussian，如果像VASP或CASTEP都有这种问题。如果只是删除原子而不考虑电子被移除，得到的是自由基的吸附。

作者
Author: gch123 时间: 2020-3-9 12:33

卡开发发发表于 2020-3-8 23:05
不涉及到周期边界的处理的话不用考虑电中性及相关修正，比如Gaussian，如果像VASP或CASTEP都有这种问题。 ...

明白了谢谢老师

作者
Author: 计算小白fly 时间: 2021-8-9 15:22

卡开发发发表于 2020-3-8 19:50
CASTEP一般而言是处理不好带电体系的，可以考虑加反电荷粒子比如H、Na等（当然是根据你实际体系而定），使 ...

老师，请问是在搭建模型时加入反电荷粒子吗？具体应该如何操作呢？平衡了电性之后是不是就不用再改变charge这个参数了呀？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-8-11 22:20

计算小白fly 发表于 2021-8-9 15:22
老师，请问是在搭建模型时加入反电荷粒子吗？具体应该如何操作呢？平衡了电性之后是不是就不用再改变char ...

比如该补Na+或H+就把这些不上咯。里面电荷转移情况通过SCF确定。

作者
Author: Nicearctic 时间: 2021-11-8 01:38
老师您好，我添加反粒子后，再优化的时候那个力选项一直不收敛，您清楚这是这么回事吗？

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