计算化学公社

标题: 请问基于Calphy的RMSD这个Calphy是什么意思？ [打印本页]

作者
Author: 王寓于 时间: 2020-3-8 21:41
标题: 请问基于Calphy的RMSD这个Calphy是什么意思？

请问基于Calphy的RMSD这个Calphy是什么意思？另外请问如果在mdp文件中删除define = -DPOSRES这一行是不是就意味着是在不添加位置限制的情况下进行计算？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-9 06:47
哪里看到的词就看哪里的说明，文中找不到细节的话就google
用不用-DPOSRES和是否用位置限制没有必然关系，这完全取决于拓扑文件怎么写的，要搞清楚gmx对拓扑文件的预处理机制以及[position_restraint]的用法

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