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标题: VMD怎么差别显示模拟后的配体 [打印本页]

作者
Author: vandenberg 时间: 2020-3-9 15:35
标题: VMD怎么差别显示模拟后的配体
跑完动力学后用抽取轨迹生成pdb轨迹文件，用pymol显示的话sequence可以方便的看到配体的序列，并且进行和蛋白的差别显示。
但是用VMD显示的时候，在sequence viewer根本找不到配体的序列，这是咋回事呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-9 20:31
sequence viewer本来就是看蛋白质的
只想看配体部分用not protein作为选区就完了

选择语句基本语法见
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504

作者
Author: vandenberg 时间: 2020-3-10 10:09

sobereva 发表于 2020-3-9 20:31
sequence viewer本来就是看蛋白质的
只想看配体部分用not protein作为选区就完了

谢谢老师

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