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标题: 过渡金属的轨道分析 [打印本页]

作者
Author: ter20 时间: 2015-8-28 16:30
标题: 过渡金属的轨道分析
求助，请问如图所示的过渡金属配合物的HOMO(α)轨道，可以认为是金属Ru和配体CO和Cp*的成键轨道吗？其中Ru-桥基CO的成键比较明显，而Ru-端基CO和Ru-Cp*的成键只有在减小isovalue至0.02左右才出现正向重叠，尤其是Ru-Cp*的轨道重叠很奇怪，附件里是轨道的cube文件，求大家指导，第一次做过渡金属配合物的计算，不是很确定。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-8-28 21:13
Ru-Cp*肯定算不上成键，反倒更像是反键轨道
更客观的判断是用Multiwfn做Mulliken键级分析，可以分解成轨道的贡献，明显正值和明显负值分别代表成键和反键贡献

作者
Author: ter20 时间: 2015-8-29 10:24
本帖最后由 ter20 于 2015-8-29 22:47 编辑

OK，明白了，做了Decompose Mulliken bond order between two atoms to orbital contributions，我这种情况就是找到HOMO(α)对应的Orbital contribution的正负情况对吧

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-8-31 15:12
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-8-31 15:13 编辑

ter20 发表于 2015-8-29 10:24
OK，明白了，做了Decompose Mulliken bond order between two atoms to orbital contributions，我这种情况 ...

你这几乎就是纯粹的反键轨道啊
给你看个典型的过渡金属 - 配体成键三个典型的成键轨道
和
一个不太典型的反键轨道（还有点儿非键轨道的意思）
(, 下载次数 Times of downloads: 96)

作者
Author: sobereva 时间: 2015-8-31 17:41

ter20 发表于 2015-8-29 10:24
OK，明白了，做了Decompose Mulliken bond order between two atoms to orbital contributions，我这种情况 ...

对

作者
Author: ter20 时间: 2015-9-1 10:02

yjcmwgk 发表于 2015-8-31 15:12
你这几乎就是纯粹的反键轨道啊
给你看个典型的过渡金属 - 配体成键三个典型的成键轨道
和

你好，我也用Multiwfn做了Topology分析，结果如图，看起来至少Ru-CO是成键轨道，应该没错吧

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-9-1 14:57

ter20 发表于 2015-9-1 10:02
你好，我也用Multiwfn做了Topology分析，结果如图，看起来至少Ru-CO是成键轨道，应该没错吧

看上去很像C和Ru成键了！
（你肯定用了ECP基组，却用fchk或wfn作了AIM分析，我猜的对吗）
AIM不能看到谁是成键轨道，只能看到谁和谁成键了

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-1 18:59

ter20 发表于 2015-9-1 10:02
你好，我也用Multiwfn做了Topology分析，结果如图，看起来至少Ru-CO是成键轨道，应该没错吧

轨道的描述有很强的任意性，我也不鼓励通过MO来考察。成不成键问题是所有轨道的总效果。
最简单的方法，你算算mayer键级就知道是否成键了。当前的情况应当是成键的。
至于AIM分析，并不代表有键径就一定有化学键，只能说化学键总伴随着键径。你的图算是成键的证据之一，但建议结合Mayer键级讨论。

作者
Author: ter20 时间: 2015-9-1 21:02

yjcmwgk 发表于 2015-9-1 14:57
看上去很像C和Ru成键了！
（你肯定用了ECP基组，却用fchk或wfn作了AIM分析，我猜的对吗）
AIM不能看到 ...

我就是按你的说法做的，用了ECP基组，然后用fchk做了multiwfn的topology分析
对AIM分析理解不深，这下明白了，以后要多看看相关文献，多谢啦！

作者
Author: ter20 时间: 2015-9-1 21:02

sobereva 发表于 2015-9-1 18:59
轨道的描述有很强的任意性，我也不鼓励通过MO来考察。成不成键问题是所有轨道的总效果。
最简单的方法 ...

Got it! 还是加上Mayer键级分析比较有说服力

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-1 21:22

ter20 发表于 2015-9-1 21:02
我就是按你的说法做的，用了ECP基组，然后用fchk做了multiwfn的topology分析
对AIM分析理解不深，这下明 ...

用.wfx文件可以保证键径一直能连到原子核位置，详见
在赝势下做波函数分析的一些说明
http://sobereva.com/156

作者
Author: ter20 时间: 2015-9-1 22:56
本帖最后由 ter20 于 2015-9-1 22:58 编辑

sobereva 发表于 2015-9-1 21:22
用.wfx文件可以保证键径一直能连到原子核位置，详见
在赝势下做波函数分析的一些说明
http://sobereva. ...

马上学习之PS: 感慨Sob知识如此浩瀚，无论巨细，都了解得很透彻，对比自己的肤浅，深感汗颜

作者
Author: zidu113 时间: 2015-9-17 21:52

sobereva 发表于 2015-9-1 18:59
轨道的描述有很强的任意性，我也不鼓励通过MO来考察。成不成键问题是所有轨道的总效果。
最简单的方法 ...

“轨道的描述有很强的任意性，我也不鼓励通过MO来考察。成不成键问题是所有轨道的总效果。”
佩服。

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