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标题: 优化表面配位结构时,吸附的离子总是发生解离 [打印本页]

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wwp    时间: 2020-3-18 12:27
标题: 优化表面配位结构时,吸附的离子总是发生解离
各位老师,我想请教一下

1.我在优化表面配位的结构时,N原子和金属原子配位之后,剩下的O-H总是会发生解离,(原本预计的是:只有N和金属原子配位.)该怎么处理?(我需要不断的调整初始结构吗?)
PS: 我尝试过拉长离子与表面的距离最终结果还是解离了.

2.这个解离的结果和整个体系的带电荷情况有关系吗?

输入文件
%nprocshared=10
%mem=2GB
%chk=30.chk
#p opt=calcfc freq b3lyp/genecp scrf=(iefpcm,solvent=acetonitrile)
geom=connectivity


解离结果图片
(, 下载次数 Times of downloads: 23)

谢谢各位老师了

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sobereva    时间: 2020-3-18 13:52
应当说清楚被吸附的分子,以及基底都是什么。也没说清楚当前体系的电荷是怎么设的

不在乎计算量的话,可以对金属和N的距离进行柔性扫描,选择恰当的点当初猜优化结构。如果柔性扫描过程都能看见氢自发转移走了,说明在当前设定、计算条件下本身这就是自发的。

作者
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wwp    时间: 2020-3-18 14:41
本帖最后由 wwp 于 2020-3-18 14:45 编辑
sobereva 发表于 2020-3-18 13:52
应当说清楚被吸附的分子,以及基底都是什么。也没说清楚当前体系的电荷是怎么设的

不在乎计算量的话,可 ...

配位离子是亚胺的碳上连接了一个过氧醇的结构,基底是氧化铝的表面,我认为是一个亚胺的N离子(带一个负电荷)配位到氧化铝的铝上。

老师柔做性扫描的话,初始猜测中氢原子和氧需要连接到一起吗?


作者
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sobereva    时间: 2020-3-19 21:15
wwp 发表于 2020-3-18 14:41
配位离子是亚胺的碳上连接了一个过氧醇的结构,基底是氧化铝的表面,我认为是一个亚胺的N离子(带一个负 ...

原本的结构是过氧醇,显然扫描的初始结构里小分子中应当是O与H连着的(指的是距离在成键范围附近)
作者
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wwp    时间: 2020-3-19 21:22
sobereva 发表于 2020-3-19 21:15
原本的结构是过氧醇,显然扫描的初始结构里小分子中应当是O与H连着的(指的是距离在成键范围附近)

嗯嗯 谢谢老师,试过了没有极大值点,单调的
作者
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sobereva    时间: 2020-3-19 22:39
wwp 发表于 2020-3-19 21:22
嗯嗯 谢谢老师,试过了没有极大值点,单调的

那就说明是自发氢转移的。对这样的体系出现这种情况在我来看很正常
作者
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wwp    时间: 2020-3-20 07:43
sobereva 发表于 2020-3-19 22:39
那就说明是自发氢转移的。对这样的体系出现这种情况在我来看很正常

嗯嗯,谢谢老师解答




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