计算化学公社

标题: 局部软度值可以比较复杂化合物之间的活性吗？ [打印本页]

作者
Author: Alisa 时间: 2020-3-21 21:40
标题: 局部软度值可以比较复杂化合物之间的活性吗？
我想请问一下：该令福井函数乘上全局软度，就得到了局部软度函数，然后以不同方式空间划分（如Hirshfeld、Becke）可以得到每个原子的局部软度值，然后比较不同金属原子的这个值。这个公式可以比较复杂化合物之间的活性吗？不仅仅是金属元素。
打扰您了，希望您抽空帮忙解答一下

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-22 14:09
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容（仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的不恰当标题“化合物活性”改了，以后务必注意。
此类问题属于波函数分析问题，不要发到量子化学版，给你移动了

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-22 14:12
复杂化合物需要说得更具体。本来这就不限于金属元素，反倒是用于主族元素用得更多

没有其它额外信息的话，而且相互比较的体系比较类似，可以拿这个来试图预测局部活性。但如果和诸如计算的势垒、实验反应速率/位点不符，就不要强行拿这个说事

作者
Author: Alisa 时间: 2020-3-23 13:36
谢谢老师，我以后注意问题的分类，但是我想知道这个计算方法可以用于相同条件下，不同化合物之间活性比较吗？希望老师可以给一个明确的回答，辛苦老师了

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-25 22:04

Alisa 发表于 2020-3-23 13:36
谢谢老师，我以后注意问题的分类，但是我想知道这个计算方法可以用于相同条件下，不同化合物之间活性比较吗 ...

化合物特征相差太大就不行
起码也得主体结构相同

作者
Author: Alisa 时间: 2020-3-26 19:01
谢谢老师，懂得了

作者
Author: Alisa 时间: 2020-3-26 21:00

sobereva 发表于 2020-3-25 22:04
化合物特征相差太大就不行
起码也得主体结构相同

谢谢老师的解答，我还有个问题就是已知该化合物的结构式，怎么计算该化合物的福井函数和软度值，麻烦老师了，希望老师可以给出详细的解答，辛苦老师了

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-28 05:25

Alisa 发表于 2020-3-26 21:00
谢谢老师的解答，我还有个问题就是已知该化合物的结构式，怎么计算该化合物的福井函数和软度值，麻烦老师 ...

用量子化学程序先优化结构，然后用Multiwfn计算，看下文
使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量
http://sobereva.com/484（http://bbs.keinsci.com/thread-13328-1-1.html）

如果体系可能的构象很多，应当先用molclus（http://www.keinsci.com/research/molclus.html）做构象搜索，找到能量最低构象再做如上计算

作者
Author: yinlina 时间: 2021-9-24 20:40
老师，我想问一下，倒数第三行的软度值与不同原子的局部软度是一个什么样的关系？最后我用高斯计算的HOMO-LUMO gap与这样一个输出结果差别挺大是什么原因？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-29 16:03

yinlina 发表于 2021-9-24 20:40
老师，我想问一下，倒数第三行的软度值与不同原子的局部软度是一个什么样的关系？最后我用高斯计算的HOMO-L ...

局部软度=软度*简缩福井函数
这点在Multiwfn手册3.25.1节明确说了

本来软度和HOMO-LUMO gap就没很好的相关性，既然你都能算物理意义严格得多的软度了，再拿HOMO-LUMO gap讨论反应性根本就没意义了

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