计算化学公社

标题: oniom分层以后缺少过度金属的信息 [打印本页]

作者
Author: laopang 时间: 2020-3-22 12:36
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作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-22 14:07
你的设置很莫名其妙，medium layer怎么设成了羧基，这样毫无意义
这么大一个体系，靠极度粗糙的UFF描述大部分，还不知道会被搞成什么鬼样子
对于这个体系，在我来看用ONIOM很难得到什么有意义的结果。拿出一个局部区域，用固定边界原子的簇模型研究就完了，根本不需要用非常折腾的ONIOM

作者
Author: laopang 时间: 2020-3-22 14:15
谢谢老师，用这些机组的原因是高的机组服务器算不动，羧酸带有氢用UFF肯定不对，所以把他也分层了，这个缺失原子的信息我不清楚是什么原因。
我尝试一下老师说的这个固定边界原子的簇模型方法看看吧。

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