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标题: 求助VASP可以通过修改POTCAR来使原子带电吗 [打印本页]

作者
Author: MADAOLay 时间: 2020-3-22 17:57
标题: 求助VASP可以通过修改POTCAR来使原子带电吗
各位论坛里的大佬，我想请问一下可以通过修改POTCAR赝势文件来让特定的原子带电子吗？我看过一篇文献里有说可以通过构建正负偶极板来模拟电场的作用，如下图所示，那么应该怎样在VASP里面做到让原子带电呢？麻烦各位给小弟指点一下迷津，谢谢大家

作者
Author: xp47 时间: 2020-3-22 19:02
VASP下修改POTCAR和修改NELEC一样都是background charge. 具体到原子所带电荷只能是算出来啥样就是啥样。https://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/NELECT.html

作者
Author: MADAOLay 时间: 2020-3-22 20:37
谢谢大佬解惑，那我问下cp2k正常来说可以做到在原子上增减电子来使其带电吗？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-3-22 21:14

MADAOLay 发表于 2020-3-22 20:37
谢谢大佬解惑，那我问下cp2k正常来说可以做到在原子上增减电子来使其带电吗？

一般这种模型可能都是通过点电荷来实现的，如果有程序支持识别点电荷，原则上可以做到。

作者
Author: hakuna 时间: 2020-3-22 21:34
就我所知，拿现成POTCAR修改，没法实现你的想法，而且这样做实际意义存疑.....
顺便一问，图片有意思，能说下来源么？

作者
Author: MADAOLay 时间: 2020-3-23 13:46

hakuna 发表于 2020-3-22 21:34
就我所知，拿现成POTCAR修改，没法实现你的想法，而且这样做实际意义存疑.....
顺便一问，图片有意思，能 ...

来自论文 Activation of CO2 on Copper Surfaces: The Synergy between Electric Field, Surface Morphology and Excess Electrons

作者
Author: MADAOLay 时间: 2020-3-23 13:52
各位老师们，我再问下vasp还有其他方法可以做到对原子带电量的控制吗？其他软件也可以，各位有接触过类似的情况或者有类似的方法可以给小弟指点一下吗

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-3-23 14:27

MADAOLay 发表于 2020-3-23 13:52
各位老师们，我再问下vasp还有其他方法可以做到对原子带电量的控制吗？其他软件也可以，各位有接触过类似的 ...

1、电荷应该不是直接在原子上的，而是以外加电荷考虑的。
2、你发来的原文是CP2K做的，可以研究一下相关资料。
3、我了解的情况，QE挂Environ插件（https://github.com/environ-developers/Environ）也能做，原则上应该是设置EXTERNAL_CHARGES下面的参数，其中dim=2，外电荷的形式应该是一个Gaussian型的平板，你可以具体看看手册。

作者
Author: MADAOLay 时间: 2020-4-16 23:50

卡开发发发表于 2020-3-22 21:14
一般这种模型可能都是通过点电荷来实现的，如果有程序支持识别点电荷，原则上可以做到。

老师，时隔这么久再来问一下，模型中点电荷的添加是通过建模软件比如materials studio之类的还是通过在仿真软件中直接设置的？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-4-17 09:47

MADAOLay 发表于 2020-4-16 23:50
老师，时隔这么久再来问一下，模型中点电荷的添加是通过建模软件比如materials studio之类的还是通过在仿 ...

QE的话挂了Environ的插件是可以直接通过设置参数给定一个Gaussian型的电荷面，不需要其他设置。MS的DMol3虽然能以点电荷来做，但是我不确定有没有什么其他的问题。

作者
Author: aaronzjw 时间: 2020-4-18 13:05
VASP 修改价电子数可以带电 NELEM

作者
Author: ykr 时间: 2020-6-22 12:07

aaronzjw 发表于 2020-4-18 13:05
VASP 修改价电子数可以带电 NELEM

好像没有查到这个参数，怎么使用呢？

作者
Author: wendawei 时间: 2020-6-22 18:56

ykr 发表于 2020-6-22 12:07
好像没有查到这个参数，怎么使用呢？

是NELECT哦，vasp手册的P73

作者
Author: 时光故事去学习 时间: 2021-10-9 22:16
请问各位老师，CP2K如何让原子带电？有类似的修改价电子数的参数或者方法吗？

作者
Author: 时光故事去学习 时间: 2021-10-9 22:25

卡开发发发表于 2020-3-22 21:14
一般这种模型可能都是通过点电荷来实现的，如果有程序支持识别点电荷，原则上可以做到。

卡老师，我在CP2K的论坛上看到有人解答如何建立电场，他说“you can define a ghost atom with a charge and no basis functions.” 请问这应该如何实现呢？是需要在基组文件和赝势文件中自己写一个带正电的氢吗？

还想请问，在CP2K中如果想让某些具体的原子带电，比如N原子，是否有办法？能否像VASP那样修改价电子数？

感谢！

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-10-10 06:09

时光故事去学习发表于 2021-10-9 22:25
卡老师，我在CP2K的论坛上看到有人解答如何建立电场，他说“you can define a ghost atom with a charge ...

看你的目的，如果是要限制某个原子带电的话需要做CDFT，据我所知目前的第一性原理软件都没有这样的功能

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-10-13 06:20

时光故事去学习发表于 2021-10-9 22:25
卡老师，我在CP2K的论坛上看到有人解答如何建立电场，他说“you can define a ghost atom with a charge ...

对，应该是自己写一个带电荷的原子，不过带不带基组要看你具体情况，我暂时说不好。另外可能也不是简单带电就成，一些因为带电需要进行的修正还是要做。

操作层面，CP2K我个人不大熟悉，你可以问问其他人；对VASP来说也不是简单改电子数就行。

作者
Author: 时光故事去学习 时间: 2021-10-13 07:40

喵星大佬发表于 2021-10-10 06:09
看你的目的，如果是要限制某个原子带电的话需要做CDFT，据我所知目前的第一性原理软件都没有这样的功能

噢~好的，谢谢喵星大佬^_^!

作者
Author: 时光故事去学习 时间: 2021-10-13 07:46

卡开发发发表于 2021-10-13 06:20
对，应该是自己写一个带电荷的原子，不过带不带基组要看你具体情况，我暂时说不好。另外可能也不是简单带 ...

好的，谢谢卡老师^_^!

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