计算化学公社

标题: 购买服务器求推荐配置 [打印本页]

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涓涓流水    时间: 2020-3-23 11:25
标题: 购买服务器求推荐配置
各位老师:
    组里最近想购置一台服务器,主要想用高斯,VASP,MS 计算有机半导体,聚合物等体系,后期可能会用到 MD,Crystal ,Comsol等软件。预算不超过10万,8-9万左右。求推荐配置!

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monoyu    时间: 2020-3-23 11:48
这个预算需要看你是不是必须走政采了,如果不需要走政采,可选择的余地还是挺大的。比如社长推荐的顶级配置,MD再搭配上合适的GPU,能组好几台吧。
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sobereva    时间: 2020-3-23 13:18
这里面的配置,顶级的买两(三)台,稍便宜的买三(四)台。具体看以什么形式购买,淘宝买最便宜,其它方式买都会有水分,若找所谓的大厂家亏一倍
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444
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涓涓流水    时间: 2020-3-23 15:47
sobereva 发表于 2020-3-23 13:18
这里面的配置,顶级的买两(三)台,稍便宜的买三(四)台。具体看以什么形式购买,淘宝买最便宜,其它方式 ...

谢谢社长,我之前看了您的帖子,根据您的推荐在淘宝上找了卖家,确实最便宜,因为不太懂,担心淘宝后续售后问题,所以还在考虑。另外还找了两家以前有课题组购买过的厂家。下面分别列出报价,麻烦社长帮忙看看哪里有问题,希望社长能给点意见。万分感谢
另外,现在也在考虑是买一台价位高一点的,还是社长推荐的"顶级量化计算用双路服务器推荐配置 ",选择后者的话,或者可以 两台?这样的话 CPU或内存或显卡等还有需要提升的吗?
1: CPU:2颗Intel Xeon Scalable Gold 6240
     内存:384GB(12*32GB)DDR4 RECC Shared MemoryNvidia
     显卡:GeForce GTX 1650 显卡
     硬盘:1TB SATA SSD固态硬盘作系统加速盘;8TB  7200RPM SATA 企业级硬盘存储数据
     报价 9万4
2:CPU: Intel Xeon Gold 6240 18C 2.60GHz 24.75MB 150W  2
    内存: 32GB DDR4-2933 ECC REG RDIMM 12
    硬盘: 2.5寸 SSD硬盘480G 3D-NAND SSD 6Gb SATA
            3.5寸 SATA硬盘4000G/7200RPM/6Gb/ SATA 1(标 准版)
   电源:2U 550W AC 白金电源(冗电源) 1
盘位类型 :2U 3.5寸8盘位类型 1
控制器类型:英特尔® 至强® 可扩展处理器 双路7*PCI-E(3*PCI-E x16+4*PCI-E x8)插槽+2*M.2 SSD 1 控制器组件: R+E27+D20:D27+C19:D27+C20:D+C20:D27 1

报价 73360


3(淘宝)
CPU: 铂金 8276  *4
内存:三星/SK/镁光 16G * 24
显卡:2080ti
固态硬盘: 4T
电源: 超微 1600Q1+1 冗余电源
主板: 超微X11QPH+
散热: 超微原装3647 *4
报价 8万
社长推荐的"顶级量化计算用双路服务器推荐配置  。


CPU:2* XEON Platinum 8173M(28核2.0G,全核睿频到2.7G,散,无集显)2*9000
散热器:2*捷豹LGA3647散热器  2*260
主板:超微X11DAI-N(C621芯片组,集显) 3200
机械硬盘:希捷ST4000NM0033企业级4TB SATA 480
固态硬盘:PM981A 1TB 1030
内存:12*三星DDR4-2666 ECC 16GB  12*530
电源:海韵S12II-620(额定620W)或 台达NX650(额定650W) 皆530  
机箱:先马黑洞玻璃版 330
键盘鼠标:罗技MK200 多媒体套装。



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涓涓流水    时间: 2020-3-23 15:52
monoyu 发表于 2020-3-23 11:48
这个预算需要看你是不是必须走政采了,如果不需要走政采,可选择的余地还是挺大的。比如社长推荐的顶级配置 ...

谢谢回复,不需要走政采,找了两家公司给组的,报价7-8万,配置似乎也不太好,也有问要不要GPU的,算MD,GPU必须的嘛?
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hakuna    时间: 2020-3-23 19:32
涓涓流水 发表于 2020-3-23 15:47
谢谢社长,我之前看了您的帖子,根据您的推荐在淘宝上找了卖家,确实最便宜,因为不太懂,担心淘宝后续售 ...

这个时候下手组机器,价格还是不错的,主要配件价格都不高。
但需要注意,有些配件和商家谈价格时,一定要弄准确你要的东西,譬如CPU,存在工程版、正显版和正式版,价格差别还是不少的,千万不要掏了正式版的钱,买个正显或ES版,况且还有拆机和全新的区别(尽管不是易损品)。内存的话,对服务器来说,虽然非原厂条子不多,也要给商家明确,散热上不要太节省,电源有全新的也有拆机的.....总之吧,都要给商家谈清楚......
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涓涓流水    时间: 2020-3-23 19:40
hakuna 发表于 2020-3-23 19:32
这个时候下手组机器,价格还是不错的,主要配件价格都不高。
但需要注意,有些配件和商家谈价格时,一定 ...

学习了,谢谢!
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liyuanhe211    时间: 2020-3-23 20:45
本帖最后由 liyuanhe211 于 2020-3-24 00:45 编辑
涓涓流水 发表于 2020-3-23 15:47
谢谢社长,我之前看了您的帖子,根据您的推荐在淘宝上找了卖家,确实最便宜,因为不太懂,担心淘宝后续售 ...

大坑。贵的离谱。
而且什么“384GB(12*32GB)DDR4 RECC Shared MemoryNvidia”这什么鬼,频率也没有牌子也没有,难道是英伟达牌内存?看人下菜故意写不清楚等着拿个垃圾条子坑你。
除非有特殊需要,内存配到384G绝大多数时候用不上,有点浪费。

主板没写

都是“1TB SATA SSD”从上到下价格差一个数量级,又等着坑你呢。另外SSD别用SATA的。

前两个直接让它滚蛋谈都别谈。

没有一些智障政策限制的话(比如必须只能买一台),8万预算最好分到2-3台里性价比较高,别都塞到一台里去。


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monoyu    时间: 2020-3-23 23:25
本帖最后由 monoyu 于 2020-3-24 00:12 编辑

你开始咨询的第1、2套方案,厂家给得报价有点离谱:不知道厂家为什么喜欢推gold 62**,我们学院之前咨询供应商给出的方案也是推62**。Gold 6240正式版淘宝一般13000左右,正显版6000-8000都有。DDR4 2666 ECC 32GB 单条700左右。 GTX 1650不到1000,而且做MD基本不会用1650这个级别吧,那么配 GTX 1650是亮机卡?
第3套方案,猜测应该是用 2049U-TR4准系统,单价20000左右。铂金 8276给你报的是正式版?正显版?还是不显?目前正显版10000左右。DDR4 2666 ECC 16GB 单条400左右。RTX 2080Ti 10000左右。那么准系统+cpu+内存+显卡≈80000,跟报价貌似刚刚好。但性价比应该不如2套×(社长推荐顶级配置+2080super),更不如2-3套×(双路8175m+2080super)。鉴于双路8175m单套25000左右(含税), 2080super 5000左右,9万差不多能搞定3套×(双路8175m+2080super)了,岂不是更加美滋滋? 我不做MD,关于MD GPU加速的配置推荐可参考社长的博文中的相关内容 http://sobereva.com/444
至于你提到的担心淘宝售后问题,找靠谱、专业、正规的商家应该问题不大,至少从我们自己课题组购置的2套机器近1年的使用过程来看,还是挺稳的。
希望能有所帮助。

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涓涓流水    时间: 2020-3-25 08:26
monoyu 发表于 2020-3-23 23:25
你开始咨询的第1、2套方案,厂家给得报价有点离谱:不知道厂家为什么喜欢推gold 62**,我们学院之前咨询供 ...

非常感谢,非常有帮助。
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涓涓流水    时间: 2020-3-25 08:26
liyuanhe211 发表于 2020-3-23 20:45
大坑。贵的离谱。
而且什么“384GB(12*32GB)DDR4 RECC Shared MemoryNvidia”这什么鬼,频率也没有牌 ...

好的,谢谢啦。
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abin    时间: 2020-3-25 09:56
昨天看到一个廉价的四口的万兆交换机。
其实,可以买三台,组建为cluster。
读写速率最低能做到300MB/s,最高能做到960MB/s。
普通机械硬盘读写,也不会长时间持续在200MB/s。

另,用SATA接口的固态硬盘做系统加速就是瞎指挥。
莫不如采用一个1TB机械盘做系统,一个或者数个盘做数据存储。

嗯,其实稍微修改一下,可以弄一套 一个管理节点+三台高性能计算节点的集群。

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zhangshuo420    时间: 2020-3-25 10:25
本帖最后由 zhangshuo420 于 2020-3-25 10:35 编辑

推荐个塔式的服务器,散热也比较好
戴尔T640 8173M 2颗      
32G内存   12根/16G 24根  三星
256G SSD 三星  2块/8T SATA企业      
1G缓存的730阵列卡     
RTX 2080TI  11G显卡  2块      
1100W电源     
大概8w5左右  
还可以再拓展2个显卡和6块硬盘

256G SSD做个装系统,做raid1 ,8T企业盘来存数据用。有阵列卡缓存数据,运行起来完全没问题。还可以自己做个虚拟化。想怎么用就怎么用。

作者
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sobereva    时间: 2020-3-25 22:12
关于LS:
装SSD做系统意义不大。计算服务器不想普通家用机,经常开关机、跑应用程序。如果数据不是那么金贵,没必要raid 1。
固态硬盘是否需要,关键看计算的任务是否需要大量读写硬盘,同样是Gaussian,跑普通泛函和后HF的情况完全不同

作者
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monoyu    时间: 2020-3-25 22:51
zhangshuo420 发表于 2020-3-25 10:25
推荐个塔式的服务器,散热也比较好
戴尔T640 8173M 2颗      
32G内存   12根/16G 24根  三星

自己搭,同样配置55000左右应该就能搞定,还是一身“名牌件”...品牌服务器还是只适合不差钱的...
作者
Author:
zhangshuo420    时间: 2020-3-26 09:21
monoyu 发表于 2020-3-25 22:51
自己搭,同样配置55000左右应该就能搞定,还是一身“名牌件”...品牌服务器还是只适合不差钱的...

自己攒的,的确是便宜。但是修修补补,都是要自己再掏真金白银的。
给系统和数据盘做raid   是预防硬盘因为寿命或者自身生产带出来的隐性缺陷,导致系统或程序出现问题。买硬盘,装系统,按程序,很是费时费力。机器没办法运行,浪费时间和精力。
同样的配置,不一样的价格。差的就是售后。
都是循环利用很需要嘛!
作者
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abin    时间: 2020-4-14 09:43
zhangshuo420 发表于 2020-3-26 09:21
自己攒的,的确是便宜。但是修修补补,都是要自己再掏真金白银的。
给系统和数据盘做raid   是预防硬盘 ...

这里可能有一个坑。
预想的情形是,RAID阵列,出问题了,直接换盘上去就可以。
实际遇到的问题可能是,由于硬件选择的关系,可能需要拆机箱来拆卸硬盘,然后你发现没有明确的指示灯之类,完全不晓得是哪一个硬盘需要更换。
如果考虑硬件RAID,机箱以及硬盘托架需要选择好,最好是能支持热插拔的,不用拆机箱的。
而且必须需要独立指示灯的。否则故障之后,就比较麻烦了。

另一个需要考虑的是,
如果硬件性能不行,可能遭遇更换硬盘后,RAID数据重建需要一段时间,
这个取决于使用的整理卡的性能。
RAID不是万能的,重建失败又不是没有。

一个非常廉价的解决方案。

买两个1 TB HDD用来做系统和软件。
系统独立安装在一个1TB HDD上。
软件和系统设定完毕后,把整个硬盘dd一下。
然后,其中一个硬盘拆下来,放着。  如果某天系统遭遇故障,或者硬盘损坏,直接拔掉,把备用的放上去。

一个普通的1 TB HDD, 大概不到300人民币吧?
直接更换硬盘,10分钟搞定啊。

系统设定完毕后,只需要接上一个硬盘, dd 操作一下呢。

当然,我是特别建议,在一个4TB 或则更大容量的HDD做数据存储,独立挂/home

如果要用到CASCF之类的计算,弄个NVME SSD做读写也不错哦,或者弄两个会更快哦。

买计算用的服务器,上来就一个4TB的HDD,外加一个256GB 固态做系统,都是十分搞笑的。
再说一遍,我个人的建议是,服务器上用固态硬盘做系统盘,毛线用都没有。

服务器主板启动都特别慢,要固态硬盘加速启动有意义吗?

当然固态硬盘有另外一个特别的用处。
比如,你需要特别多的内存,但是有搞不到比如5TB之类的内存,
那么可以使用NVME高速固态硬盘来救急:多几个,RAID0, 然后挂载到SWAP啊。
看不懂这几行啥意思,那就不用看了。

作者
Author:
ylbt1989    时间: 2020-4-20 11:33
abin 发表于 2020-4-14 09:43
这里可能有一个坑。
预想的情形是,RAID阵列,出问题了,直接换盘上去就可以。
实际遇到的问题可能是, ...

学习到了,最近正在搭建小集群 太感谢了!很有用
作者
Author:
abin    时间: 2020-4-20 13:23
ylbt1989 发表于 2020-4-20 11:33
学习到了,最近正在搭建小集群 太感谢了!很有用

建议看看这个http://bbs.keinsci.com/thread-16010-1-1.html
并建议看看后续的更新说明。
作者
Author:
ylbt1989    时间: 2020-4-20 14:30
abin 发表于 2020-4-20 13:23
建议看看这个http://bbs.keinsci.com/thread-16010-1-1.html
并建议看看后续的更新说明。

谢谢




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