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标题: 求助联合原子力场模型的建模问题 [打印本页]

作者
Author: qaz 时间: 2020-3-24 20:32
标题: 求助联合原子力场模型的建模问题
我最近在用lammps软件进行分子动力学模型，模拟的是c10h22直链烷烃，但需要建立联合原子力场模型，不知道该怎么建立模型，是用MS,packmol,或者是其它软件呢，或者能直接下载呢，希望看到的大神可以回复一下，感激不尽。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-25 14:57
我并不用Lammps。单纯说建模，如果是指画单个结构，用gview或Chemdraw->Chem3D都可以，也可以自己写SMILES字符串然后用Openbabel产生结构（参考比如http://sobereva.com/440）
如果说已经有了单个结构，想要建凝聚相盒子，用packmol即可，参考《分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用》（http://sobereva.com/473）。
也许针对Lammps还有其它更好的方法，但我不清楚。

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