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标题: 请教Energy minimization的tolerance的设定 [打印本页]

作者
Author: yihanxu 时间: 2020-3-26 05:47
标题: 请教Energy minimization的tolerance的设定
老师好，一般EM的tolerance用100 kJ/mol/nm足够, 但读到一篇文章用的10 kcal/mol/ Å (equals 418 kJ/mol/nm) ,所以想请问tolerance的范围一般在什么区间？最大的话是多少呢？如果是周期性体系，与盒子的大小有关吗，盒子越大tolerance需要设的越小？
谢谢。

P.S. 不知为什么总有个在段落里，请忽略。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-26 16:59
设多大看目的是什么。
如果只是为了MD不会一开始就崩，EM稍微做做就可以，用不着收敛得太严
但如果你是想基于分子力场优化的结构相互对比能量，那就应当收敛得严一些。如果之后是要做振动分析，最好收敛得更严，否则可能出现虚频。

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