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标题: gaussian计算500个左右原子体系的能量为什么会出现内存错误？ [打印本页]

作者
Author: 涓涓流水 时间: 2020-3-27 17:23
标题: gaussian计算500个左右原子体系的能量为什么会出现内存错误？
各位老师，我用gaussian计算一个500个原子体系的单点能，方法特意选了HF，不算频率，内存和CPU大大小小，或者不指定，各种试，无论在自己服务器还是超算中心算总是出现内存错误，配置的内存应该都是够的，这种情况是为什么呢？请大家帮忙看一下是方法软件不适合这么大体系还是有别的问题呢？S atom may be hypervalent but has no d functions.是什么意思？有影响吗？谢谢！
输入：
%chk=A1.chk
#p hf/6-31g
Title Card Required
0 1
输出：
Warning!  S  atom 66 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  408 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  409 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  423 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  424 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  438 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  439 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  453 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  454 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  468 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  469 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  483 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  484 may be hypervalent but has no d functions.

IExCor= 0 DFT=F Ex=HF Corr=None ExCW=0 ScaHFX=  1.000000
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000 ScalE2=  1.000000  1.000000
IRadAn=    0 IRanWt=    -1 IRanGd=          0 ICorTp=0
NAtoms=  496 NActive=  496 NUniq=  496 SFac= 7.50D-01 NAtFMM= 80 NAOKFM=T Big=T
Leave Link  301 at Fri Mar 27 17:04:11 2020, MaxMem= 33554432 cpu:    0.0
(Enter /public1/home/sc50754/g09/l302.exe)
NPDir=0 NMtPBC=    1 NCelOv=    1 NCel=    1 NClECP=    1 NCelD=    1
      NCelK=    1 NCelE2=    1 NClLst=    1 CellRange=    0.0.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=  3124 RedAO= T  NBF=  3124
NBsUse=  3124 1.00D-06 NBFU=  3124
Leave Link  302 at Fri Mar 27 17:05:16 2020, MaxMem= 33554432 cpu:    64.1
(Enter /public1/home/sc50754/g09/l303.exe)
DipDrv:  MaxL=1.
Out-of-memory error in routine ShPair-CalcS2-2 (IEnd=    15962994 MxCore=    14029431)
Use %mem=34MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.
Error termination via Lnk1e in /public1/home/sc50754/g09/l303.exe at Fri Mar 27 17:05:17 2020.
Job cpu time:  0 days  0 hours  1 minutes  4.9 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 491 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1

作者
Author: zjxitcc 时间: 2020-3-27 17:38
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-3-27 17:43 编辑

Terrible。反面教材典型。。。
（1）hf/6-31g是自己玩着用的，产生垃圾结果，没有发表价值。还“方法特意选了HF”。。。
（2）没有指定核数、没有指定内存=偏偏有内力却封住不用。
（3）6-31G对S来讲没有d函数，所以你会出现这种警告，如果这句中文还是不理解，说明需要学习基组知识。。。
你就算用万金油搭配B3LYP/6-31G(d) em=GD3BJ也不至于这步田地。。。

赶紧看Sob老师博文学习吧
《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336
《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272

作者
Author: sobereva 时间: 2020-3-28 05:03
提示写得已经超级明白了
Use %mem=34MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.

看此文了解Gaussian的运行资源的设定常识
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

作者
Author: 涓涓流水 时间: 2020-3-30 10:05

zjxitcc 发表于 2020-3-27 17:38
Terrible。反面教材典型。。。
（1）hf/6-31g是自己玩着用的，产生垃圾结果，没有发表价值。还“方法特意 ...

可以正常运行了，谢谢！去学习了~

作者
Author: 涓涓流水 时间: 2020-3-30 10:06

sobereva 发表于 2020-3-28 05:03
提示写得已经超级明白了
Use %mem=34MW to provide the minimum amount of memory required to complete t ...

谢谢社长！可以运行了。

作者
Author: Freesky 时间: 2020-5-17 07:06
请问具体是怎么解决的啊？

作者
Author: 虎王 时间: 2020-8-28 16:23

涓涓流水发表于 2020-3-30 10:05
可以正常运行了，谢谢！去学习了~

请问如何解决这个难题的？

作者
Author: 雪见容馥 时间: 2021-4-27 20:52
请问怎么解决这个难题的

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-4-27 21:36

雪见容馥发表于 2021-4-27 20:52
请问怎么解决这个难题的

从哪里看出这是个难题的

作者
Author: 雪见容馥 时间: 2021-4-28 16:33

喵星大佬发表于 2021-4-27 21:36
从哪里看出这是个难题的

对于小白来说算是难处理吧

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-3 02:44

雪见容馥发表于 2021-4-27 20:52
请问怎么解决这个难题的

但凡输出信息里都十分明确给你答案的自然就不是难题

作者
Author: 友好的小狗 时间: 2025-6-2 12:47

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)