计算化学公社

标题: psi4运行核心数是单核，如何修改？ [打印本页]

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-4-2 22:03
标题: psi4运行核心数是单核，如何修改？
按照卢老师的帖子安装的psi4，用帖子中的H2O-NH3的输入文件计算了一下，看输出文件好像是单核运行的，想请老师看看是否有问题。我在运行时，设置了6GB内存，64核心运行，不知道实际运行是否按照此设定进行的。如果不是的话，应该如何去设置呢？

作者
Author: hzfish 时间: 2020-4-2 22:11
psi4 -i inputfile -o outfile -n x
x表示核数。

作者
Author: snljty 时间: 2020-4-2 22:13

psi --help | grep -i 'thread'

复制代码

结果

usage: psi4 [-h] [-i INPUT] [-o OUTPUT] [-a] [-V] [-n NTHREAD] [-s SCRATCH]
-n NTHREAD, --nthread NTHREAD
Number of threads to use. Psi4 disregards OMP_NUM_THREADS/MKL_NUM_THREADS.

复制代码

帮助里面写了用-n指定线程数
善用--help参数。

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-4-2 23:07
计算时，psi4 sapt.inp sapt.out -n 64 但是看输出文件 Threads: 1

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-4-3 10:37

hzfish 发表于 2020-4-2 22:11
psi4 -i inputfile -o outfile -n x
x表示核数。

计算时就是用的这样的命令，但是看输出文件好像是单核运行的。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-4-3 11:18
就是用-n，和我博文里写的完全一致
使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算
http://sobereva.com/526（http://bbs.keinsci.com/thread-15902-1-1.html）

我的输出文件里的信息

Process ID: 4528
Host: localhost.localdomain
PSIDATADIR: /sob/psi4_132/share/psi4
Memory: 500.0 MiB
Threads: 36
==> Input File <==

复制代码

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-4-3 16:33

sobereva 发表于 2020-4-3 11:18
就是用-n，和我博文里写的完全一致
使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算
http://sobereva.com/ ...

老师，我看您博文里计算时用的-n 36，输出文件也显示Threads :36，可以对的上。我在计算时，用的-n 64，输出文件显示 Threads :1. 不知道问题存在哪里。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-4-4 04:46

风起时想你发表于 2020-4-3 16:33
老师，我看您博文里计算时用的-n 36，输出文件也显示Threads :36，可以对的上。我在计算时，用的-n 64， ...

这个最好去PSI4论坛看开发者怎么说，可能需要一些特殊设置

作者
Author: j5888xm 时间: 2020-10-12 13:35

风起时想你发表于 2020-4-3 16:33
老师，我看您博文里计算时用的-n 36，输出文件也显示Threads :36，可以对的上。我在计算时，用的-n 64， ...

同问，解决了吗

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-10-12 14:50

j5888xm 发表于 2020-10-12 13:35
同问，解决了吗

已解决。修改计算平台的作业脚本就正常了。

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