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标题: 求助,牵引力模拟准备mdp文件的pull设置出现问题 [打印本页]

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Author:
小土豆    时间: 2020-4-3 12:42
标题: 求助,牵引力模拟准备mdp文件的pull设置出现问题
ERROR 1 [file pull.mdp]:
  When the maximum distance from a pull group reference atom to other atoms
  in the group is larger than 0.5 times half the box size a centrally
  placed atom should be chosen as pbcatom. Pull group 2 is larger than that
  and does not have a specific atom selected as reference atom.

Pull group  natoms  pbc atom  distance at start  reference at t=0
       1       221       111
       2       128      8683       4.078 nm          4.078 nm

这该怎么解决呢,大佬们~


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DwyaneWan    时间: 2020-4-5 22:22
亲测。2019版本不行,2018.6版本就可以!
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小土豆    时间: 2020-4-8 11:29
DwyaneWan 发表于 2020-4-5 22:22
亲测。2019版本不行,2018.6版本就可以!

这。。。。。那好吧
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小土豆    时间: 2020-4-8 11:29
DwyaneWan 发表于 2020-4-5 22:22
亲测。2019版本不行,2018.6版本就可以!

我用的2019.2版本  哭泣~~
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pubertystory    时间: 2020-4-25 00:57
你的mdp文件的pull相关参数是什么吗?大概需要怎么牵引吗?
作者
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xhliu    时间: 2021-5-25 22:22
同样遇到这个问题 ,所哟 高版本都运行不下去吗??




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