计算化学公社

标题: 求助：gromacs模拟如何计算组分间作用力？ [打印本页]

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作者
Author: SpongeBob    时间: 2020-4-19 17:47
标题: 求助：gromacs模拟如何计算组分间作用力？
在gromacs模拟中如何计算组分间作用力？通过哪个命令可以得到组分间作用力随时间的变化呢？谢谢大家

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作者
Author: mol    时间: 2020-4-19 22:10
好像没有现成的命令，多半得自己写个脚本了

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作者
Author: SpongeBob    时间: 2020-4-20 13:04

mol 发表于 2020-4-19 22:10
好像没有现成的命令，多半得自己写个脚本了

嗯嗯好的谢谢！！！

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作者
Author: corei70715    时间: 2020-4-20 21:30
分组后重跑轨迹，再gmx energy，可以输出组间的相互作用。可以查看gmx energy帮助文档

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作者
Author: SpongeBob    时间: 2020-4-21 13:31

corei70715 发表于 2020-4-20 21:30
分组后重跑轨迹，再gmx energy，可以输出组间的相互作用。可以查看gmx energy帮助文档

对于这一部分我有个小白问题，我是想energy计算出来的是能量吧？

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作者
Author: corei70715    时间: 2020-4-21 14:23

SpongeBob 发表于 2020-4-21 13:31
对于这一部分我有个小白问题，我是想energy计算出来的是能量吧？

emmm不是求相互作用的能量么？你要的是力？force？

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作者
Author: SpongeBob    时间: 2020-4-21 18:07

corei70715 发表于 2020-4-21 14:23
emmm不是求相互作用的能量么？你要的是力？force？

是的  我想求力 force

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作者
Author: ZZH0711    时间: 2025-11-19 16:09
请问最后怎么解决的？我也想求两个组分之间的force

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