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标题: 计算结合自由能的mdp文件参数中关于lambda选项的设置不理解 [打印本页]

作者
Author: one.piece 时间: 2020-4-20 18:27
标题: 计算结合自由能的mdp文件参数中关于lambda选项的设置不理解
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这是mdp文件中关于freeenergy的参数信息，我有两个问题想求问一下
1.为什么在能量最小化，npt平衡，nvt平衡，生产相模拟里面都要写入图中的所有参数，难道不是只需要最后一步生产相模拟的mdp文件里写入就好了嘛？
2.图中vdw-lambda和coul-lambda代表范德华力和静电耦合量，这些值设定有什么讲究？
诚挚感谢诸位阅读，希望能小小地指导我一下。

作者
Author: happy青青 时间: 2025-9-11 11:18
最近也在研究gmx下做fep，感觉是每一个窗口里，从min开始就进行lamda的过渡了，设定讲究的话，貌似现在不流行图片上面这种切换方法了

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