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标题: 在GMX跑MD的时候，需要对力场进行修正吗？ [打印本页]

作者
Author: Alan123 时间: 2020-4-23 22:18
标题: 在GMX跑MD的时候，需要对力场进行修正吗？
老师，请问要得到一个可信的实验结果，需要在模拟之前对于力场的一些参数进行修正吗？前段时间，有位经常使用MS进行MD的老师和我说，在进行一个新体系的模拟之前最好对使用的力场进行修正，所以我想问下使用GMX模拟的时候，需不需要对力场文件进行修正，如果需要修正，应该如何修正呢？

作者
Author: fhh2626 时间: 2020-4-23 23:22
看你跑的是什么体系了

作者
Author: sobereva 时间: 2020-4-24 00:08
没有特殊原因不要做这种多余的事
对于多数问题，通常都有表现良好、已经被文献广为使用的力场。若没有经验和理论功底的话，瞎调只会被审稿人质疑，或者觉得是在瞎凑数据。
只有当发现模拟结果和实际有严重不符，而且可以充分论证确实就是由于力场参数而非其它的因素导致模拟结果不理想，这时才有必要对力场参数进行修改。

作者
Author: Alan123 时间: 2020-4-24 21:21

sobereva 发表于 2020-4-24 00:08
没有特殊原因不要做这种多余的事
对于多数问题，通常都有表现良好、已经被文献广为使用的力场。若没有经验 ...

嗯嗯好的，谢谢社长解答，明白了

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