更好的做法是如2L所述,导出轨迹做法参考
将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法 http://sobereva.com/143
不过文中的做法不能直接导出速度信息,想导出的话需要修改脚本作者Author: 菲儿菲儿 时间: 2020-4-28 18:26
感谢两位老师,请帮我看下下面这个脚本可以用么?
set outfile [open ***.dat w];
set nf [molinfo top get numframes]
for { set i 1 } { $i<=$nf } { incr i 1} {
set atom [atomselect top "该分子10A以内的水分子"]
$atom frame $i
$atom update
set com [$atom num]
puts $outfile "$i $com"
}
close $outfile,作者Author: 顺利毕业发paper 时间: 2021-6-28 09:48