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标题: Orca能否排队执行计算任务？ [打印本页]

作者
Author: lao7 时间: 2015-9-10 08:08
标题: Orca能否排队执行计算任务？
搞Orca时，遇到两个问题，说明书看了一下没有找到解决方法。
1）orca能否像高斯一样，用类似于g09 <A.gjf>A.out; g09 <B.gjf>B.out &的方法，排队执行多个任务？
2）同一个用户名下，同时安装高斯和orca，输入 .bashrc或者/.bashrc内容时，发现两个软件安装的语句都写在一起了，source之后，.bashrc或者/.bashrc就打不开了，显示无此命令。晕，如果把两个软件装在同一个用户名下，避免此类情况发生。
谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-10 08:31
1 可以，这和程序没关系，对所有程序都通用。
2 不清楚你的具体情况，ORCA和Gaussian不冲突。ORCA本身也不需要什么配置。我一般建议把配置高斯的部分写在.bashrc靠前部分，因为source g09.profile文件的时候可能会把一些自行设的环境变量搞乱。

作者
Author: lao7 时间: 2015-9-10 09:23

sobereva 发表于 2015-9-10 08:31
1 可以，这和程序没关系，对所有程序都通用。
2 不清楚你的具体情况，ORCA和Gaussian不冲突。ORCA本身也不 ...

谢谢！第2项问题：我没有介绍清楚，是装并行软件openmpi的时候出的报错问题。我把高斯的写在.bashrc，把openmpi的写在/.bashrc里面，但打开/.bashrc之后，先前写的高斯的配置文件也在里面，下面接着继续写入openmpi配置文件，resource之后出现找不到命令的问题了。连cd用户都进不去了。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-10 09:51
比如用root，就都在/root/.bashrc里面写就行了，不知道你用的/.bashrc是什么。
如果现在已经进不去，你用安装盘进入恢复模式把文件改回去就行了。

作者
Author: lao7 时间: 2015-9-10 10:30
谢谢我重装了系统 centos7很难搞定 home下居然连用户文件夹都没有我把两个软件分别装在两个用户名下吧谢谢指教不懂的问题继续请教

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-9-11 14:48
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-9-11 15:05 编辑

lao7 发表于 2015-9-10 10:30
谢谢我重装了系统 centos7很难搞定 home下居然连用户文件夹都没有我把两个软件分别装在两个用户名下吧 ...

如果是刚刚装好的centos系统，/home自然没有子文件夹。因为root账户对应/root除了root账户对应的文件夹在/root之外，其他任何账户对应的文件夹都挂在/home下。
不知道lao7平时用什么系统。按照我的使用来说，在我的服务器里的centos和在我的PC里的ubuntu的目录结构差别还是挺大的。比如说吧，在centos里，/media基本就是个废弃目录，而在ubuntu中，基本被废弃的目录是/mnt。别的系统，俺不知道。当年俺刚接触ubuntu的时候，对于自动挂载在/media很不适应，其实不过就是个习惯问题罢了。

不知道sob看到这个回帖会说什么。印象中sob挺鄙视centos的……嫌他土……也许只有我这种土人才会坚持centos吧
不同的人喜欢不同的系统（与其说是喜欢某个系统，不如说是熟悉某个系统或者习惯某个系统），不喜欢（不熟悉、不习惯）就直接换了。
我认识一个奇葩的家伙，自己的服务器里装win server

但是人家习惯了，也能满足他的需求，这就是好系统

作者
Author: 万里云 时间: 2015-9-11 15:30
"/.bashrc"这个少打了一个"~"吧？

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-9-11 21:25
请问ORCA和高斯的功能类似吗？有啥优缺点吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-12 08:34

lastzealot 发表于 2015-9-11 21:25
请问ORCA和高斯的功能类似吗？有啥优缺点吗？

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1558

作者
Author: lao7 时间: 2015-9-12 08:45

yjcmwgk 发表于 2015-9-11 14:48
如果是刚刚装好的centos系统，/home自然没有子文件夹。因为root账户对应/root除了root账户对应的文件夹在 ...

我用过其他系统，当然小红帽也用过，但很不喜欢小红帽界面的红色，看了像红色警戒2的游戏界面。而且当时也发现对至强v3处理器的桌面支持较差，很卡顿(也可能版本较低，centos低版本也会很卡)。现在用centos7桌面图形很好，界面也清爽，唯一的缺点，在home下面，图形界面居然看不到用户文件夹，但在终端输入时，必须写出home下的用户名文件夹路径。个人喜好不同吧！

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-9-12 09:50
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-9-12 09:53 编辑

lao7 发表于 2015-9-12 08:45
我用过其他系统，当然小红帽也用过，但很不喜欢小红帽界面的红色，看了像红色警戒2的游戏界面。而且当时 ...

额……不知道你用centos干什么。我个人认为centos不适合做PC的操作系统（尤其是需要图形界面的地方）。如果要做桌面操作台来用，真心习惯了ubuntu。我的centos只活在服务器里，几乎没开过图形界面。甚至后来购买的新服务器连x window都不装了。

装win7和ubuntu14双系统的新PC用来干活儿 + 装centos6或7的cluster用来干苦力 + 装centos7的旧PC用来搞实验（作大死）是完美组合

抱歉！歪楼了！回到正题，我的orca是安装在单独账户里的。其实这本来也没什么，orca跟gaussian的环境变量据说不冲突，但是我还是分开了，这样肯定不会有问题嘛！
又及，你在一楼写的/.bashrc是不是写错了？你想表达的是~/.bashrc么？

作者
Author: lao7 时间: 2015-9-12 21:05

yjcmwgk 发表于 2015-9-12 09:50
额……不知道你用centos干什么。我个人认为centos不适合做PC的操作系统（尤其是需要图形界面的地方）。如 ...

谢谢我分开装在不同用户文件夹中没有任何问题。.bashrc用来装高斯，～/.bashrc用来装orca

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-9-12 23:13

sobereva 发表于 2015-9-12 08:34
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1558

谢谢老师

作者
Author: stecue 时间: 2015-9-18 03:41
本帖最后由 stecue 于 2015-9-18 03:42 编辑

lao7 发表于 2015-9-12 21:05
谢谢我分开装在不同用户文件夹中没有任何问题。.bashrc用来装高斯，～/.bashrc用来装orca

你是用root账户做计算的吗？.bashrc和~/.bashrc不是一个东西么？如果你随便写在一个其他什么路径的话.bashrc也起不到作用。

另外为什么要重装系统呢？.bashrc不对的话你直接用root账户进去吧~your_account/.bashrc备份后删掉不就得了。

作者
Author: lao7 时间: 2015-9-18 07:50
不用root账户，当时系统搞坏了，又重装的。现在把两个软件装在两个用户名下。

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