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标题: 求助自由基异构体计算 [打印本页]

作者
Author: zoey 时间: 2020-5-7 23:01
标题: 求助自由基异构体计算
老师好，我需要优化得到a和b两个自由基结构，直接优化得到的结构中C1和C2都是sp2杂化构型，是不是我这样优化不正确，对于自由基的这两种异构体优化该怎么处理？

# opt freq 6-31g** m062x scf=xqc

C-A-a-SDD

0 2
C -1.36667800 0.88564400 -0.00024500
C 0.00347700 1.43793600 0.00019100
....
.....
....

作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2020-5-8 04:02
本帖最后由 Daniel_Arndt 于 2020-5-9 03:59 编辑

你最好先说清楚你自己想做什么。你的图就是烯丙基自由基的两个共振式，对应的几何结构应该是一样的。

作者
Author: zoey 时间: 2020-5-8 08:25

Daniel_Arndt 发表于 2020-5-8 04:02
你最好先说清楚你自己想做什么。你的图就是两个烯丙基自由基的两个共振式，对应的几何结构应该是一样的。

老师好，我把初始结构调成a和b的构型，优化后得到的构型是一样的，单电子不在C1或C2上。是不是没法优化后得到自由基在C1上的a构型和自由基在C2上的b构型? 还是我的计算有问题？

作者
Author: snljty 时间: 2020-5-8 08:41

zoey 发表于 2020-5-8 08:25
老师好，我把初始结构调成a和b的构型，优化后得到的构型是一样的，单电子不在C1或C2上。是不是没法优化后 ...

复习一下有机化学中什么是构型。构型指的是原子核位置的区别，和电子分布没有关系。不同的电子结构的共振极限式之间不是不同构型的关系，是通过变分描述同一个几何结构下的更真实的电子结构的。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-8 08:58

zoey 发表于 2020-5-8 08:25
老师好，我把初始结构调成a和b的构型，优化后得到的构型是一样的，单电子不在C1或C2上。是不是没法优化后 ...

从一般的量化计算角度来说，a和b没有任何区别
到底单电子是怎么分布的是你算完了做波函数分析才知道的，凡是和你预期的不符的几乎一定都是你预期的不符。另外，有机书里很多说法、电子结构画法都是定性错误的，根本都没恰当考虑电子的离域本质。

作者
Author: zoey 时间: 2020-5-15 08:35

sobereva 发表于 2020-5-8 08:58
从一般的量化计算角度来说，a和b没有任何区别
到底单电子是怎么分布的是你算完了做波函数分析才知道的， ...

谢谢老师

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