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标题: 求助主-客体复合物的势能面扫描问题 [打印本页]

作者
Author: 吃西瓜的佩奇 时间: 2020-5-8 12:01
标题: 求助主-客体复合物的势能面扫描问题
请问sob老师，主-客体复合物的接触距离扫描是在复合物优化之前进行，还是得到能量最低点的距离后再进行优化呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-9 03:06
都可以，取决于实际目的。
如果你就是想得到从平衡位置开始解离过程的能量变化，应当先优化复合物，否则你无法事先知道平衡位置是多少。

作者
Author: 吃西瓜的佩奇 时间: 2020-5-9 12:41

sobereva 发表于 2020-5-9 03:06
都可以，取决于实际目的。
如果你就是想得到从平衡位置开始解离过程的能量变化，应当先优化复合物，否则你 ...

我在确定了能量最低点的接触距离时，进行界面优化后接触距离发生了改变，而且主客体的接触位置也改变了，该怎么解决呢？

作者
Author: thanhtam 时间: 2020-5-9 21:40
本帖最后由 thanhtam 于 2020-5-9 21:41 编辑

吃西瓜的佩奇发表于 2020-5-9 12:41
我在确定了能量最低点的接触距离时，进行界面优化后接触距离发生了改变，而且主客体的接触位置也改变了， ...

你的“确定能量最低点”是指扫描吗？那当然会变。

怎么解决取决于你的目的是什么

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