计算化学公社

标题: 如何理解gmx select -olt选项? [打印本页]

作者
Author:
Riddermark    时间: 2020-5-12 17:46
标题: 如何理解gmx select -olt选项?
如何理解gmx select -olt选项?看官网With -olt, a histogram is produced that shows the number of selected positions as a function of the time the position was continuously selected. -cumlt can be used to control whether subintervals of longer intervals are included in the histogram

是说选择的粒子持续存在于所选择区域里的时间的长短分布吗?
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sobereva    时间: 2020-5-12 23:35
应该是
作者
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Riddermark    时间: 2020-5-13 08:52
sobereva 发表于 2020-5-12 23:35
应该是

谢谢老师,再请教一下得到的结果(下图里面)是类似10个粒子在区域里存在了1ps,10个粒子存在了0.5ps这种吗?纵坐标有点看不懂,我在想是不是可以用这个算滞留时间
作者
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Riddermark    时间: 2020-5-13 08:52
老师,你看看这个图呢
作者
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sobereva    时间: 2020-5-14 15:58
Riddermark 发表于 2020-5-13 08:52
老师,你看看这个图呢

比如曲线穿过了大概(50,10)的位置,此处含义我估计是诸如,被选择的位置里面,平均有10个能在50 ps内一直满足选择语句。
作者
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Riddermark    时间: 2020-5-17 15:16
sobereva 发表于 2020-5-14 15:58
比如曲线穿过了大概(50,10)的位置,此处含义我估计是诸如,被选择的位置里面,平均有10个能在50 ps内一直 ...

谢谢老师啦




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