计算化学公社

标题: 求助：gromacs中关于REMD收敛的图的制法 [打印本页]

作者
Author: xxj9618 时间: 2015-9-14 11:22
标题: 求助：gromacs中关于REMD收敛的图的制法
最近在做REMD的数据处理，看到文献里有这样的图形我用gromacs不知道怎么制作，所以想请教一下如何实现，谢谢大家。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-14 12:53
计算轨迹每一帧的回转半径Rg，然后统计一下在不同Rg数值区间内帧数各有多少，除以总帧数就是概率（这个可以自己写个小程序，也可以用origin的频数统计），然后绘制成dot+line图即可。

作者
Author: xxj9618 时间: 2015-9-15 09:40

sobereva 发表于 2015-9-14 12:53
计算轨迹每一帧的回转半径Rg，然后统计一下在不同Rg数值区间内帧数各有多少，除以总帧数就是概率（这个可以 ...

谢谢sob老师，第一步我会的，我来试试第二步

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)