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标题: 蛋白质二级结构的命名规则求助 [打印本页]

作者
Author: yogurt 时间: 2020-5-25 18:15
标题: 蛋白质二级结构的命名规则求助
请问我用dssp和pymol都得到了每个氨基酸对应的二级结构文件。只不过我不懂命名。比如说1-20是螺旋，21-30是loop区，31-38是折叠，39-45是螺旋，那两个螺旋分别是α1和α2么？因为我看到文献中有α1，α1’。所以不太懂。 (, 下载次数 Times of downloads: 19) 比如文献中这里提到的β11和β12是PDB文件中约定俗成的，还是坐着自己命名。谢谢老师。

作者
Author: yogurt 时间: 2020-5-25 21:07
(, 下载次数 Times of downloads: 19)

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-26 07:33

yogurt 发表于 2020-5-25 21:07

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并反映出帖子具体内容，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“二级结构的命名规则 ›”改了，以后务必注意，下次将扣分处理。

按二级结构出现顺序自己命名就可以。pdb没有统一规则

作者
Author: yogurt 时间: 2020-5-26 10:22
谢谢老师。

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