计算化学公社

标题: VASP能做离子吸附吗？建模的时候吸附的离子怎么处理？ [打印本页]

作者
Author: Sureviver 时间: 2020-5-26 12:30
标题: VASP能做离子吸附吗？建模的时候吸附的离子怎么处理？
我想做一个氯离子吸附在金属表面，作结构优化，算一下结合能和电荷变化，看金属表面吸附位的的差分电荷密度，建模的时候氯离子应该怎么处理？还是说VASP不能算这类情况，应该用什么软件算好？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-26 15:22
用量子化学程序结合簇模型就可以研究，参考
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540（http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html）
文中说了怎么算结合能。密度差按此文计算和绘制
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

作者
Author: Sureviver 时间: 2020-5-26 15:27

sobereva 发表于 2020-5-26 15:22
用量子化学程序结合簇模型就可以研究，参考
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sob ...

谢谢老师，我先看看帖子学习学习，有不明白的再向您请教（发帖发错版，下次一定注意

）

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-5-26 18:34

Sureviver 发表于 2020-5-26 15:27
谢谢老师，我先看看帖子学习学习，有不明白的再向您请教（发帖发错版，下次一定注意）

可以做。用vaspsol插件https://github.com/henniggroup/VASPsol/，里面有特定的补偿方法，而且本来也就该考虑溶剂化效应。

作者
Author: Sureviver 时间: 2020-5-31 14:22

卡开发发发表于 2020-5-26 18:34
可以做。用vaspsol插件https://github.com/henniggroup/VASPsol/，里面有特定的补偿方法，而且本来也就该 ...

好，谢谢，我研究研究

作者
Author: reductioncat. 时间: 2020-6-11 05:46
VASP可以算。离子吸附就是正常的吸附然后像卡老师说的考虑solvation energy 会更准确。
另一个需要注意的是离子的reference energy. 直接把离子放在气态计算是没有考虑离子的电荷。你可以用解离的反应热去反推离子在气态时候的能量。
这一点比较复杂我也还在学习中。

作者
Author: 華華 时间: 2020-11-12 01:35

reductioncat. 发表于 2020-6-11 05:46
VASP可以算。离子吸附就是正常的吸附然后像卡老师说的考虑solvation energy 会更准确。
另一个需要注意 ...

你好，我想问一下考虑离子吸附优化时，关键词是用NELECT来实现的吗？

作者
Author: Maxmium 时间: 2021-9-27 12:17

卡开发发发表于 2020-5-26 18:34
可以做。用vaspsol插件https://github.com/henniggroup/VASPsol/，里面有特定的补偿方法，而且本来也就该 ...

谢谢老师的回答，超算上安装了vaspsol，但是不明白离子吸附如何设定，是不是建模的时候直接建一个比如Na原子的吸附并打开vaspsol计算就可以了？不明白电子的分配是怎么做到的。期待得到您的指点。

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-9-28 19:18

Maxmium 发表于 2021-9-27 12:17
谢谢老师的回答，超算上安装了vaspsol，但是不明白离子吸附如何设定，是不是建模的时候直接建一个比如Na ...

分配是在自洽场计算中电荷就会重新分布。另外VASPSOL的校正可能只能用于上下表面对称的结构。

作者
Author: Maxmium 时间: 2021-9-29 09:54

卡开发发发表于 2021-9-28 19:18
分配是在自洽场计算中电荷就会重新分布。另外VASPSOL的校正可能只能用于上下表面对称的结构。

明白了，这就试试，谢谢您的回答

作者
Author: Gris 时间: 2024-11-27 07:39

Maxmium 发表于 2021-9-27 12:17
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您好，请问您问题解决了吗，利用vaspsol计算表面带电粒子吸附的话不需要单独去设置电荷分布是吗，只需要把建好的原子吸附模型用vaspsol跑就可以了？这里NELECT需要设置吗？求指点

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