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标题: 激发态中对二面角进行势能面扫描的相关问题 [打印本页]

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zhujianhao    时间: 2020-5-26 12:33
标题: 激发态中对二面角进行势能面扫描的相关问题
各位老师好,最近在做激发态势能面的扫描,请教一些问题:

1.对分子的二面角做180°的扫描,用到的初始结构必须是优化后的能量最低点吗?我得到的能量最低点二面角是8.7°,但是阅读了几篇文献,发现里面的二面角扫描都是整数为起点,比如0°。这是如何处理的?基于优化后的结构,调整二面角为0°,然后开始扫描吗?
2.扫描激发态二面角,必须基于激发态的结构吗?基态的可以吗?比如,用优化完的基态,调整二面角为0度,输入命令【# opt=modredundant td pbe1pbe/6-31g(d) scrf=(solvent=toluene) nosymm 】,可行吗?
3.关于保存坐标作图,基态可以右击直接保存。而激发态,比如s1,发现直接保存的能量最低点,与优化S1的能量,差距过大;而发现在log里的singlet(下图)一步步读的,差距小,是否需要去log里的singlet一个个读取?




作者
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sobereva    时间: 2020-5-26 15:55
1 不要求事先优化

2 初始结构完全随意

3 看不懂你的描述。问扫描问题时首先要说清楚是刚性扫描还是柔性扫描
作者
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zhujianhao    时间: 2020-5-26 17:48
sobereva 发表于 2020-5-26 15:55
1 不要求事先优化

2 初始结构完全随意

第三个问题我没表达清楚,我想问的是,计算柔性势能面扫描后,想把数据提取出来用origin作图,数据如何取,在输出文件哪个位置? 谢谢sob老师
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sobereva    时间: 2020-5-27 05:03
zhujianhao 发表于 2020-5-26 17:48
第三个问题我没表达清楚,我想问的是,计算柔性势能面扫描后,想把数据提取出来用origin作图,数据如何取 ...

gview打开,进入results - scan,点右键把数据提取出来
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zhujianhao    时间: 2020-5-27 10:08
sobereva 发表于 2020-5-27 05:03
gview打开,进入results - scan,点右键把数据提取出来

好的 ,非常感谢老师!
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zhujianhao    时间: 2020-5-27 12:22
来补充下帖子,这几天特殊情况用的老台式机里的gview5,咨询了下才知道5里显示的能量是结构下基态的电子能,得把激发能自己加上去才是激发态的电子能。而6是可以直接右键保存能量的哈哈




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