计算化学公社

标题: 求助CP2K优化好的结构导入Multiwfn来计算弱相互作用 [打印本页]

作者
Author: sunshixx 时间: 2020-5-26 22:29
标题: 求助CP2K优化好的结构导入Multiwfn来计算弱相互作用
各位老师好，我是一名Multiwfn的新手，最近在使用Multiwfn的时候遇到了一些问题。想来请教一下各位老师。
我使用CP2K优化好的结构（xyz）导入Multiwfn来计算弱相互作用,在绘制散点图时发现并无任何散点图像显示。我看到sob老师的教程里是用的wfn文件，但是由于软件的原因，想请问下xyz格式文件是否可以生成同样的散点图？
任何帮助都万分感谢！！！

作者
Author: sunshixx 时间: 2020-5-26 22:39
各位老师补充下，我查看了output，后两列都是0。这导致了画不出来图。请问老师们有什么好办法吗

作者
Author: snljty 时间: 2020-5-26 23:01
看卢老师的
《详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换》
http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html
通常xyz格式不含有波函数，只有坐标，不能基于分子波函数做波函数分析，只能基于准分子密度等做弱相互作用分析，比如基于准分子密度的NCI分析，这和基于波函数的有区别。
看卢老师的
《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》
http://sobereva.com/68
《Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览》
http://sobereva.com/252

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-27 04:43
都已经选了[Multiwfn使用咨询]分类了，就不要再在标题上手动写一遍[Multiwfn使用咨询]。给你去掉了。

不同分析功能需要的信息不同，仔细看
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

另外，图楼上里提到的我的博文所示，Multiwfn支持的弱相互作用分析功能一大把，提问时应当说清楚用的是什么分析功能。
诸如IGM（http://sobereva.com/407）、promolecular近似下的RDG分析、Hirshfeld surface方式的弱相互作用分析（http://sobereva.com/701）都可以基于xyz文件来做。

作者
Author: sunshixx 时间: 2020-5-27 10:52
好的，万分感谢各位老师！！！

作者
Author: beefly 时间: 2020-5-27 18:00
曾经有人用CP2K输出molden文件，然后用Multiwfn做分析

作者
Author: sunshixx 时间: 2020-5-27 22:13

beefly 发表于 2020-5-27 18:00
曾经有人用CP2K输出molden文件，然后用Multiwfn做分析

哦哦，我看到那篇帖子啦，感谢

作者
Author: sunshixx 时间: 2020-5-27 22:15

sobereva 发表于 2020-5-27 04:43
都已经选了[Multiwfn使用咨询]分类了，就不要再在标题上手动写一遍[Multiwfn使用咨询]。给你去掉了。

不 ...

老师，还有一个问题，我用cp2k生成了wfn文件，但是导入multiwfn，回车之后就闪退了，很多遍都是这样。请问这是不是说明无法识别cp2k导出的wfn文件呢

作者
Author: beefly 时间: 2020-5-28 13:09

sunshixx 发表于 2020-5-27 22:15
老师，还有一个问题，我用cp2k生成了wfn文件，但是导入multiwfn，回车之后就闪退了，很多遍都是这样。请 ...

cp2k存的一些数据有问题。曾经遇到过原子数，占据轨道数，或者基函数个数不一致

作者
Author: sunshixx 时间: 2020-5-28 19:16

beefly 发表于 2020-5-28 13:09
cp2k存的一些数据有问题。曾经遇到过原子数，占据轨道数，或者基函数个数不一致

哦哦，我明白了。万分感谢！！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-29 07:39

sunshixx 发表于 2020-5-27 22:15
老师，还有一个问题，我用cp2k生成了wfn文件，但是导入multiwfn，回车之后就闪退了，很多遍都是这样。请 ...

Multiwfn载入不了的wfn文件肯定是wfn文件不符合规范，可以参考此文检查文件哪里有问题
利用wfn文件计算电子密度的代码的编写方法
http://sobereva.com/182

目前Multiwfn还没有明确考虑对CP2K的兼容性，以后可能会考虑

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