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标题: 关于Quantum ESPRESSO 6.5 的GPU加速 [打印本页]
作者
Author: MilkTeaLegend    时间: 2020-5-27 14:42
标题: 关于Quantum ESPRESSO 6.5 的GPU加速
本帖最后由 MilkTeaLegend 于 2020-5-28 13:55 编辑

上次看到现在QE的GPU加速介绍效果显著。这次特意尝试


# 环境
- Centos 8  i9 9900K  RTX 2080
- PGI 19.10 编译器 cuda 10.1
- q-e-gpu-qe-gpu-6.5a2.tar.gz


要用GPU加速的话必须用PGI编译器


编译过程当然有一点波折要点是要注意PGI编译与相应cuda版本的适配。


# 测试结果
利用GPU后速度的提升是显著的
测试的简单的晶体硅的输入文件。特别调高了Ecut和Kpoints。
  1. &control
  2.     calculation = 'relax',
  3.     prefix = 'Si_exc2',
  4.     verbosity = 'high'
  5.     outdir = './Sitmp/'
  6.     pseudo_dir = ' ../qePotential/'
  7. /
  8. &system
  9.     ibrav =  2,
  10.     celldm(1) = 10.348,
  11.     nat =  2,
  12.     ntyp = 1,
  13.     ecutwfc = 200,
  14. /
  15. &electrons
  16.     mixing_beta = 0.7
  17. /
  18. &IONS
  19.         ion_dynamics= 'bfgs'
  20. /

  22. ATOMIC_SPECIES
  23. Si 28.086  Si.pbe-rrkj.UPF

  25. ATOMIC_POSITIONS (alat)
  26. Si 0.0 0.0 0.0
  27. Si 0.25 0.25 0.25

  29. K_POINTS (automatic)
  30.   24 24 24 0 0 0

复制代码
纯CPU的耗时：i9-9900K 8核 Openmpi并行

  1.      init_run     :    120.08s CPU    138.31s WALL (       1 calls)
  2.      electrons    :   1234.34s CPU   1236.01s WALL (       1 calls)
  3.      forces       :     33.85s CPU     31.33s WALL (       1 calls)

  5.      Called by init_run:
  6.      wfcinit      :    119.89s CPU    138.11s WALL (       1 calls)
  7.      wfcinit:atom :      0.11s CPU      0.08s WALL (     413 calls)
  8.      wfcinit:wfcr :    119.30s CPU    137.69s WALL (     413 calls)
  9.      potinit      :      0.03s CPU      0.04s WALL (       1 calls)
  10.      hinit0       :      0.01s CPU      0.01s WALL (       1 calls)

  12.      Called by electrons:
  13.      c_bands      :   1224.15s CPU   1225.82s WALL (       6 calls)
  14.      sum_band     :      9.98s CPU      9.95s WALL (       6 calls)
  15.      v_of_rho     :      0.17s CPU      0.18s WALL (       6 calls)
  16.      v_h          :      0.01s CPU      0.01s WALL (       6 calls)
  17.      v_xc         :      0.16s CPU      0.17s WALL (       6 calls)
  18.      mix_rho      :      0.02s CPU      0.02s WALL (       6 calls)

  20.      Called by c_bands:
  21.      init_us_2    :      1.47s CPU      1.28s WALL (    5782 calls)
  22.      cegterg      :   1089.74s CPU   1126.66s WALL (    2478 calls)

  24.      Called by sum_band:

  26.      Called by *egterg:
  27.      h_psi        :    475.77s CPU    430.73s WALL (    7653 calls)
  28.      g_psi        :      0.58s CPU      0.46s WALL (    4762 calls)
  29.      cdiaghg      :     15.91s CPU     16.89s WALL (    6827 calls)
  30.      cegterg:over :    541.66s CPU    647.80s WALL (    4762 calls)
  31.      cegterg:upda :      4.09s CPU      6.08s WALL (    4762 calls)
  32.      cegterg:last :      7.65s CPU     10.62s WALL (    2489 calls)

  34.      Called by h_psi:
  35.      h_psi:calbec :    168.44s CPU    153.30s WALL (    7653 calls)
  36.      vloc_psi     :    292.57s CPU    229.73s WALL (    7653 calls)
  37.      add_vuspsi   :     14.29s CPU     47.29s WALL (    7653 calls)

  39.      General routines
  40.      calbec       :    201.88s CPU    184.18s WALL (    9305 calls)
  41.      fft          :      0.15s CPU      0.14s WALL (      62 calls)
  42.      ffts         :      0.00s CPU      0.00s WALL (       6 calls)
  43.      fftw         :    285.14s CPU    224.69s WALL (   68524 calls)

  45.      Parallel routines

  47.      PWSCF        :  23m 8.68s CPU  23m26.22s WALL


  50.    This run was terminated on:  13:55:40  27May2020            
复制代码
GPU加速版本的耗时： CPU单进程OMP并行 RTX2080 加速
  1.      Writing output data file ./Sitmp/Si_exc2.save/

  3.      init_run     :     19.37s CPU     19.43s WALL (       1 calls)
  4.      electrons    :     22.95s CPU     27.86s WALL (       1 calls)
  5.      forces       :      0.41s CPU      0.47s WALL (       1 calls)

  7.      Called by init_run:
  8.      wfcinit      :     17.93s CPU     18.19s WALL (       1 calls)
  9.                                        18.19s GPU  (       1 calls)
  10.      wfcinit:atom :     12.71s CPU     13.54s WALL (     413 calls)
  11.                                        13.54s GPU  (     413 calls)
  12.      wfcinit:wfcr :      4.06s CPU      3.75s WALL (     413 calls)
  13.                                         3.75s GPU  (     413 calls)
  14.      potinit      :      0.70s CPU      0.49s WALL (       1 calls)
  15.      hinit0       :      0.30s CPU      0.31s WALL (       1 calls)

  17.      Called by electrons:
  18.      c_bands      :     18.69s CPU     23.42s WALL (       6 calls)
  19.      sum_band     :      2.61s CPU      3.15s WALL (       6 calls)
  20.                                         3.15s GPU  (       6 calls)
  21.      v_of_rho     :      2.14s CPU      1.54s WALL (       6 calls)
  22.      v_h          :      0.29s CPU      0.21s WALL (       6 calls)
  23.      v_xc         :      1.85s CPU      1.33s WALL (       6 calls)
  24.      mix_rho      :      0.04s CPU      0.05s WALL (       6 calls)

  26.      Called by c_bands:
  27.      init_us_2    :      0.31s CPU      0.62s WALL (    5782 calls)
  28.                                         0.60s GPU  (    5782 calls)
  29.      cegterg      :     17.78s CPU     22.13s WALL (    2478 calls)

  31.      Called by sum_band:
  32.      sum_band:wei :      0.00s CPU      0.00s WALL (       6 calls)
  33.                                         0.00s GPU  (       6 calls)
  34.      sum_band:loo :      2.52s CPU      3.06s WALL (       6 calls)
  35.                                         3.06s GPU  (       6 calls)
  36.      sum_band:buf :      0.44s CPU      0.53s WALL (    2478 calls)
  37.                                         0.22s GPU  (    2478 calls)
  38.      sum_band:ini :      0.22s CPU      0.28s WALL (    2478 calls)
  39.                                         0.27s GPU  (    2478 calls)

  41.      Called by *egterg:
  42.      cdiaghg      :      1.88s CPU      2.25s WALL (    6807 calls)
  43.                                         2.23s GPU  (    6807 calls)
  44.      cegterg:over :      0.70s CPU      0.85s WALL (    4742 calls)
  45.      cegterg:upda :      0.79s CPU      0.95s WALL (    4742 calls)
  46.      cegterg:last :      0.37s CPU      0.44s WALL (    2488 calls)
  47.      h_psi        :     15.51s CPU     18.32s WALL (    7633 calls)
  48.                                        18.25s GPU  (    7633 calls)
  49.      g_psi        :      0.01s CPU      0.10s WALL (    4742 calls)
  50.                                         0.09s GPU  (    4742 calls)

  52.      Called by h_psi:
  53.      h_psi:calbec :      0.22s CPU      0.95s WALL (    7633 calls)
  54.                                         0.93s GPU  (    7633 calls)
  55.      vloc_psi     :     13.18s CPU     15.54s WALL (    7633 calls)
  56.                                        15.46s GPU  (    7633 calls)
  57.      add_vuspsi   :      0.10s CPU      1.67s WALL (    7633 calls)
  58.                                         1.62s GPU  (    7633 calls)

  60.      General routines
  61.      calbec       :      0.25s CPU      0.30s WALL (    9285 calls)
  62.      fft          :      0.83s CPU      0.71s WALL (      62 calls)
  63.                                         0.00s GPU  (       2 calls)
  64.      ffts         :      0.02s CPU      0.02s WALL (       6 calls)
  65.      fftw         :      0.54s CPU     17.50s WALL (   17744 calls)
  66.                                        15.73s GPU  (   17744 calls)

  68.      Parallel routines

  70.      PWSCF        :     44.89s CPU     50.07s WALL


  73.    This run was terminated on:  13:28:57  27May2020            

  75. =------------------------------------------------------------------------------=
  76.    JOB DONE.
  77. =------------------------------------------------------------------------------=
复制代码
# 能量结果的对比
GPU ： E=-15.7419293645 Ry   与 CPU ： E = -15.7419293674

# 某二维材料的测试
输入文件
  1. &control
  2.     calculation = 'scf',
  3.     verbosity = 'high'
  4.     prefix = '2D'
  5.     outdir = './tmp/'
  6.     pseudo_dir = '/home/kan/opt/qePotential'
  7. /
  8. &system
  9.     a           =  1.64969e+01
  10.     b           =  1.64809e+01
  11.     c           =  15
  12.     cosab       = -5.00000e-01
  13.     degauss     =  1.00000e-02
  14.     ecutrho     =  250
  15.     ecutwfc     =  25
  16.     ibrav       = 12
  17.     nat         = 30
  18.     ntyp        = 2
  19.     occupations = 'smearing',
  20.     smearing = 'gauss',
  21.     degauss = 0.01
  22. /

  24. &electrons
  25.         mixing_beta = 0.7
  26.         diagonalization= 'cg'
  27. /

  29. &IONS
  30.         ion_dynamics = 'bfgs'
  31. /

  33. ATOMIC_SPECIES
  34. C      12.01070  C.pbe-rrkjus.UPF
  35. H       1.00794  H.pbe-rrkjus.UPF

  37. ATOMIC_POSITIONS {angstrom}
  38. C       3.759785   7.611155  14.310000
  39. C       3.760673   9.047720  14.311500
  40. C       2.543351   9.754656  14.318500
  41. C       2.540098  11.162104  14.319500
  42. C       4.977963   9.754085  14.308000
  43. C       4.981391  11.161391  14.309500
  44. C       1.295809  11.880316  14.324000
  45. C       3.760766  11.862617  14.315500
  46. C       6.225577  11.879459  14.306000
  47. C      -6.953221  13.788314  14.301000
  48. C      -4.488410  13.804585  14.308000
  49. C       2.531580   0.233219  14.300500
  50. C       2.534926   1.640667  14.296500
  51. C      -2.023371  13.787029  14.320000
  52. C       4.972708   0.232220  14.309500
  53. C       4.969455   1.639668  14.307000
  54. C       3.752380   2.346747  14.301000
  55. C       3.753598   3.783312  14.299500
  56. C       0.234245  12.489482  14.323000
  57. C       3.757615   6.387113  14.301500
  58. C       8.482504  13.178148  14.300000
  59. C       3.755934   5.007354  14.298500
  60. C      -0.961807  13.177863  14.321500
  61. C       7.286753  12.489625  14.300000
  62. H       1.602888   9.212001  14.325000
  63. H       5.918147   9.210859  14.304000
  64. H       3.761210  12.948498  14.315500
  65. H      -4.488936  12.718847  14.312000
  66. H       1.594577   2.183608  14.290000
  67. H       5.909835   2.182466  14.310500

  69. K_POINTS {automatic}
  70. 6 6 6 1 1 1
复制代码
系统共有30个原子。晶格参数为16 15 15 90 90 120


# 结果
CPU
  1.      init_run     :    401.09s CPU    353.32s WALL (       1 calls)
  2.      electrons    :   8844.01s CPU   7169.17s WALL (       1 calls)

  4.      Called by init_run:
  5.      wfcinit      :    388.52s CPU    340.92s WALL (       1 calls)
  6.      potinit      :      5.47s CPU      5.41s WALL (       1 calls)
  7.      hinit0       :      1.37s CPU      1.40s WALL (       1 calls)

  9.      Called by electrons:
  10.      c_bands      :   7654.70s CPU   6098.04s WALL (      10 calls)
  11.      sum_band     :   1147.25s CPU   1032.24s WALL (      10 calls)
  12.      v_of_rho     :     21.04s CPU     20.15s WALL (      11 calls)
  13.      newd         :     16.67s CPU     14.98s WALL (      11 calls)
  14.      mix_rho      :      4.30s CPU      4.16s WALL (      10 calls)

  16.      Called by c_bands:
  17.      init_us_2    :    138.32s CPU     83.76s WALL (    2268 calls)
  18.      cegterg      :   7498.05s CPU   5989.51s WALL (    1080 calls)

  20.      Called by sum_band:
  21.      sum_band:bec :      0.28s CPU      0.15s WALL (    1080 calls)
  22.      addusdens    :     21.31s CPU     17.90s WALL (      10 calls)

  24.      Called by *egterg:
  25.      h_psi        :   5827.95s CPU   5188.31s WALL (    6834 calls)
  26.      s_psi        :    513.20s CPU    260.90s WALL (    6834 calls)
  27.      g_psi        :     76.59s CPU     49.46s WALL (    5646 calls)
  28.      cdiaghg      :    124.75s CPU     77.94s WALL (    6726 calls)

  30.      Called by h_psi:
  31.      h_psi:calbec :    535.22s CPU    273.96s WALL (    6834 calls)
  32.      vloc_psi     :   4704.55s CPU   4583.96s WALL (    6834 calls)
  33.      add_vuspsi   :    530.43s CPU    279.99s WALL (    6834 calls)

  35.      General routines
  36.      calbec       :    672.30s CPU    344.31s WALL (    7914 calls)
  37.      fft          :     22.85s CPU     20.19s WALL (     140 calls)
  38.      ffts         :      0.86s CPU      0.67s WALL (      21 calls)
  39.      fftw         :   4332.56s CPU   4224.93s WALL (  430228 calls)
  40.      interpolate  :      2.67s CPU      2.11s WALL (      11 calls)

  42.      Parallel routines

  44.      PWSCF        :      2h34m CPU      2h 6m WALL


  47.    This run was terminated on:  23:57:34  26May2020            

  49. =------------------------------------------------------------------------------=
  50.    JOB DONE.
  51. =------------------------------------------------------------------------------=
复制代码
GPU
  1.      init_run     :     69.06s CPU     70.96s WALL (       1 calls)
  2.      electrons    :    869.82s CPU   1094.89s WALL (       1 calls)

  4.      Called by init_run:
  5.      wfcinit      :     57.72s CPU     62.73s WALL (       1 calls)
  6.                                        62.73s GPU  (       1 calls)
  7.      wfcinit:atom :     17.87s CPU     17.65s WALL (     108 calls)
  8.                                        17.65s GPU  (     108 calls)
  9.      wfcinit:wfcr :     25.30s CPU     32.09s WALL (     108 calls)
  10.                                        32.09s GPU  (     108 calls)
  11.      potinit      :      8.01s CPU      5.03s WALL (       1 calls)
  12.      hinit0       :      1.89s CPU      1.75s WALL (       1 calls)

  14.      Called by electrons:
  15.      c_bands      :    788.03s CPU    998.58s WALL (      10 calls)
  16.      sum_band     :     60.12s CPU     76.17s WALL (      10 calls)
  17.                                        76.17s GPU  (      10 calls)
  18.      v_of_rho     :     17.67s CPU     16.32s WALL (      11 calls)
  19.      v_h          :      3.17s CPU      3.03s WALL (      11 calls)
  20.      v_xc         :     14.51s CPU     13.29s WALL (      11 calls)
  21.      newd         :      3.26s CPU      2.97s WALL (      11 calls)
  22.                                         2.97s GPU  (      11 calls)
  23.      mix_rho      :      1.85s CPU      1.87s WALL (      10 calls)

  25.      Called by c_bands:
  26.      init_us_2    :      1.58s CPU      3.53s WALL (    2268 calls)
  27.                                         3.52s GPU  (    2268 calls)
  28.      ccgdiagg     :    621.69s CPU    786.45s WALL (    1080 calls)
  29.      wfcrot       :    171.90s CPU    222.11s WALL (    1080 calls)
  30.                                       222.10s GPU  (    1080 calls)

  32.      Called by sum_band:
  33.      sum_band:wei :      0.00s CPU      0.00s WALL (      10 calls)
  34.                                         0.00s GPU  (      10 calls)
  35.      sum_band:loo :     58.52s CPU     74.38s WALL (      10 calls)
  36.                                        74.38s GPU  (      10 calls)
  37.      sum_band:buf :      8.23s CPU      9.17s WALL (    1080 calls)
  38.                                         9.17s GPU  (    1080 calls)
  39.      sum_band:ini :      1.46s CPU      1.69s WALL (    1080 calls)
  40.                                         1.69s GPU  (    1080 calls)
  41.      sum_band:cal :      0.01s CPU     20.07s WALL (    1080 calls)
  42.                                        18.99s GPU  (    1080 calls)
  43.      sum_band:bec :      0.48s CPU      0.60s WALL (    1080 calls)
  44.                                         0.60s GPU  (    1080 calls)
  45.      addusdens    :      0.59s CPU      0.77s WALL (      10 calls)
  46.                                         0.77s GPU  (      10 calls)
  47.      addusd:skk   :      0.00s CPU      0.59s WALL (      20 calls)
  48.                                         0.04s GPU  (      20 calls)

  50.      Called by *cgdiagg:
  51.      h_psi        :    471.10s CPU    602.42s WALL (  175710 calls)
  52.                                       594.50s GPU  (  175710 calls)
  53.      s_psi        :     80.77s CPU    288.43s WALL (  350340 calls)
  54.                                       209.39s GPU  (  350340 calls)

  56.      Called by h_psi:
  57.      h_psi:calbec :      1.28s CPU    109.14s WALL (  175710 calls)
  58.                                       108.60s GPU  (  175710 calls)
  59.      vloc_psi     :    277.59s CPU    360.35s WALL (  175710 calls)
  60.                                       348.22s GPU  (  175710 calls)
  61.      add_vuspsi   :     16.65s CPU    129.33s WALL (  175710 calls)
  62.                                       128.79s GPU  (  175710 calls)
  63.      hs_1psi      :    433.05s CPU    550.15s WALL (  174630 calls)
  64.                                       542.08s GPU  (  174630 calls)
  65.      s_1psi       :    136.31s CPU    172.91s WALL (  174630 calls)
  66.                                       171.61s GPU  (  174630 calls)

  68.      General routines
  69.      calbec       :      1.95s CPU      2.56s WALL (  351420 calls)
  70.      fft          :     11.07s CPU     11.02s WALL (     140 calls)
  71.                                         0.43s GPU  (      11 calls)
  72.      ffts         :      0.25s CPU      0.25s WALL (      21 calls)
  73.      fftw         :      2.30s CPU    398.12s WALL (  362868 calls)
  74.                                       341.16s GPU  (  362868 calls)
  75.      interpolate  :      1.01s CPU      1.01s WALL (      11 calls)

  77.      Parallel routines

  79.      PWSCF        :  15m51.38s CPU  19m39.30s WALL


  82.    This run was terminated on:  13:44:33  28May2020  
复制代码



可见对于现在的PW,K点的计算。高性能的GPU加速是大有裨益的。

作者
Author: biogon    时间: 2020-5-27 16:06
不知道大体系如何
作者
Author: 风飞    时间: 2020-5-27 21:01
本帖最后由 风飞 于 2020-5-29 21:40 编辑

请问您的计算机配置是？QE6.5做计算是对CPU的要求高还是GPU的呢？请问您使用的GPU哪个型号的吗？
作者
Author: 喵星大佬    时间: 2020-5-29 21:35
能介绍一下碰到了那些坑嘛
作者
Author: gswylq    时间: 2020-5-29 23:52
请问楼主的主板是什么型号？
作者
Author: ghifi37    时间: 2020-6-1 23:35
竟然能加速近30倍？太牛了，后面一定要折腾gpu版，说我的fortran不支持Icuda参数，有空一定要弄弄
作者
Author: leagle    时间: 2020-6-8 13:47
目前只有pw可以加速吗，其他功能是不是不可以
作者
Author: k64_cc    时间: 2020-6-22 20:54
最坑的其实是内存问题。家用级显存8G，专业级也才12G，算个超胞就要跪了……
作者
Author: ghifi37    时间: 2020-6-26 13:15
请问楼主编译时，中途有没出错？除了系统是Ubuntu18.04外，我所用的软件环境和楼主一样，在bin的文件夹里产生了58个文件后，报错：PGF90-S-0084-Illegal use of symbol radial_grid_type - not public entity of module (import_upf.f90: 29)而终止，非GPU时产生了大约77个文件。
我也试过低版本的，反正都没正常完成GPU版本的编译，请教下还有啥需要注意的事项没？
作者
Author: MilkTeaLegend    时间: 2020-6-26 16:18
ghifi37 发表于 2020-6-26 13:15
请问楼主编译时，中途有没出错？除了系统是Ubuntu18.04外，我所用的软件环境和楼主一样，在bin的文件夹里产 ...

现在GPU实际起大作用的只有pw
所以make 时候不需要make all , make all 有些模块有问题 编译到一半直接退出
分别 make pw ; make pp ; make cp ... 即可
作者
Author: ghifi37    时间: 2020-6-26 22:32
MilkTeaLegend 发表于 2020-6-26 16:18
现在GPU实际起大作用的只有pw
所以make 时候不需要make all , make all 有些模块有问题 编译到一半直接 ...

感谢告知，那实际上已经编译成功绝大部分了，测试了下，感觉比GPU的VASP还要费显存。
作者
Author: ghifi37    时间: 2020-6-28 19:49
实际试了下，感觉有接近6倍的加速，挺不错的！就是显存是个问题
CPU with GPU
       Step     Time          Energy         fmax
LBFGS:    0 14:47:47    -2173.299157        0.6692
LBFGS:    1 14:50:10    -2173.345309        0.4611
LBFGS:    2 14:52:27    -2173.379739        0.5246
LBFGS:    3 14:54:41    -2173.387804        0.3019
LBFGS:    4 14:57:03    -2173.391530        0.0909
LBFGS:    5 14:59:33    -2173.392151        0.0847
Total consumption time: 706

Only CPU
       Step     Time          Energy         fmax
LBFGS:    0 15:40:42    -2173.299157        0.6692
LBFGS:    1 15:55:37    -2173.345309        0.4611
LBFGS:    2 16:09:31    -2173.379739        0.5246
LBFGS:    3 16:22:31    -2173.387804        0.3019
LBFGS:    4 16:35:36    -2173.391530        0.0909
LBFGS:    5 16:49:32    -2173.392151        0.0847
Total consumption time: 4130

Speed-up ration: 4130/706=5.8
作者
Author: ghifi37    时间: 2020-7-9 12:55
试用了几次，发现要用好QE的GPU加速还是挺难的：
1、对现存要求太高，只是一个单进程单线程，测试了49个原子的体系，12G的现存不够用，zhegvdx_gpu error: cusolverDnZpotrf failed! 后直接退出；
2、不支持跨显卡分配显存，至少对CC35是这样的；
3、不支持不同架构的显卡同时混用。
最大的问题还是显存占用太厉害，相比VASP大约80个原子的一个进程只要2、3G显存，QE的GPU还是没法在稍大一点的体系中使用。
或者哪位兄台折腾看看怎么把显存占用降下来！
作者
Author: MilkTeaLegend    时间: 2020-7-9 15:43
本帖最后由 MilkTeaLegend 于 2020-7-9 15:45 编辑
ghifi37 发表于 2020-7-9 12:55
试用了几次，发现要用好QE的GPU加速还是挺难的：
1、对现存要求太高，只是一个单进程单线程，测试了49个原 ...

参考这页 使用 cg方法可以改善显存的压力。当然这不解决根本问题。
我用下来 发现 显存的耗费主要和cell大小有关。 我 用1080ti 发现 15 15 15 以下的cell是没问题的。 只用单进程也确实比CPU快。

QE 的GPU版是把计算都放到了GPU上了。 我发现CPU 确实不动。
实测 可以加载CPU版的QE的路径 进行计算的同时，加载GPU版的路径 ；进行另一个计算。 同时用满CPU和GPU完全没问题。

还是希望能有什么4张P100的同学尝试进一步进行大体系的测试。
作者
Author: m083020036    时间: 2020-7-10 13:12
你好，看到你有用GPU编译qe的性能测试文章，我非常感兴趣，我试着尝试编译，过程中有发生一些问题，所以我想请教你有关GPU编译的问题。
1.能请教你GPU完整编译过程吗? 过程中有启用哪些环境变数?
2.编译完的qe，我该如何下指令执行。
作者
Author: gswylq    时间: 2020-7-10 22:37
测试发现scf快，relax慢
作者
Author: 风飞    时间: 2020-8-3 09:29
MilkTeaLegend 发表于 2020-7-9 15:43
参考这页 使用 cg方法可以改善显存的压力。当然这不解决根本问题。
我用下来 发现 显存的耗费主要和cell ...

您好，我的是体系大概有１００个原子，现在进行的是吸附体系的结构优化，２４小时只跑了４５步，而且还没有算完，虽然能量有收敛的趋势，但是这还是太慢了，
（硬件：双路 正式版8171M （26核2.3G，全核睿频3.0G），内存１２*1６Ｇ， 还0.5T的固态，2T的企业级机械硬盘，（双系统，所以固态和机械分了1半给windows），
我的输入文件如下，
第一是想请老师帮忙优化一下输入文件，
其次是是想咨询一下您，如果买ＧＰＵ进行加速，我这能算的动吗？因为您帖子中说ＧＰＵ特别耗显存，我怕买回来显存不够用 (, 下载次数 Times of downloads: 78)
作者
Author: Theor_Comp    时间: 2020-10-8 11:49
您好，我一直使用的CPU版的QE，现在想用GPU加速，硬件需要做什么改变吗？不知道我的能不能用GPU加速QE
作者
Author: sobereva    时间: 2020-10-15 06:38
Theor_Comp 发表于 2020-10-8 11:49
您好，我一直使用的CPU版的QE，现在想用GPU加速，硬件需要做什么改变吗？不知道我的能不能用GPU加速QE

买个诸如RTX 2080Ti之类高端GPU即可
作者
Author: dmh1998dmh    时间: 2020-11-4 18:12
楼主能详细介绍一下PGI编译器编译QE的方法吗？
作者
Author: 喵星大佬    时间: 2021-3-5 19:19
dmh1998dmh 发表于 2020-11-4 18:12
楼主能详细介绍一下PGI编译器编译QE的方法吗？

新的QE6.7-GPU版本可以使用新的Cuda和免费的Nvidia HPC SDK编译了

Nvidia HPC SDK安装起来比起以前的PGI简单很多了。

方法也一样，而且也没碰到什么坑
作者
Author: m083020036    时间: 2021-3-24 12:42
喵星大佬 发表于 2021-3-5 19:19
新的QE6.7-GPU版本可以使用新的Cuda和免费的Nvidia HPC SDK编译了

Nvidia HPC SDK安装起来比起以前的P ...

不好意思 能请教你QE GPU编译详细流程吗
我用Nvidia HPC SDK和自带cuda11.2 configure一直失败
1.想请问你有使用那些环境变数
2.cuda可以使用Nvidia HPC SDK自带的吗 还是说需要另外安装cuda
3../configure --with-cuda=/opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/21.2/cuda/11.2/ --with-cuda-runtime=11.2 --with-cuda-cc=75 --enable-openmp
这是我指令是这样下 但就是不会过
4.这是我使用的环境变数
export NVARCH=`uname -s`_`uname -m`
export NVCOMPILERS=/opt/nvidia/hpc_sdk
export MANPATH=$MANPATH:$NVCOMPILERS/$NVARCH/21.2/compilers/man
export PATH=$NVCOMPILERS/$NVARCH/21.2/compilers/bin:$PATH
export PATH=/opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/21.2/cuda/11.2/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/21.2/cuda/11.2/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
但都会出现这些错误
checking for cuInit in -lcuda... no
configure: error: in `/root/q-e-gpu':
configure: error: Couldn't find libcuda
See `config.log' for more details

请问我该如何解决
作者
Author: 喵星大佬    时间: 2021-3-24 21:25
m083020036 发表于 2021-3-24 12:42
不好意思 能请教你QE GPU编译详细流程吗
我用Nvidia HPC SDK和自带cuda11.2 configure一直失败
1.想请 ...

所有相关细节均在贴子中
http://bbs.keinsci.com/thread-22198-1-1.html



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