计算化学公社

标题: 审稿人难道是让我详细讨论量子化学理论？ [打印本页]

作者
Author: 13366149259 时间: 2020-5-27 16:36
标题: 审稿人难道是让我详细讨论量子化学理论？
各位老师好，最近回复了一篇稿件的审稿意见，审稿人可能是认为我的introduction里应该讨论我文章所使用的量子化学工具（DFT, MBO），也可能是我理解的不对，请老师同学们指导~

作者
Author: 13366149259 时间: 2020-5-27 16:37
本帖最后由 13366149259 于 2020-5-27 16:42 编辑

头大，上一条关于审稿意见的请教，没写完... 对不起，占用公众资源了。
下边是审稿人的意见：
“Further,the computational tools,which is the main discussionhere, including DFT, tools like QSAR, MBO applications… are not discussed atall. Search and USE the reference papers or reviews like the one you put yet:Chem. Rev. 2003, 103, 1793-1873; from Prof. Geerlings, in the introduction, andto refresh, the work of Worth,…: Curr. Med. Chem. 2012, 19, 5219-5225 (DOI:10.2174/092986712803530548); Expert Opin. Drug Deliv. 2010, 7, 295-305 (DOI:10.1517/17425240903508756).” （我将审稿人指出的的参考文献，作为附件一并上传了）
所以请教老师们，我是简单的说该工具的应用呢，还是详细的讨论DFT的理论背景和发展呢？若是后者，我该从哪些方面，简要的介绍呢？
谢谢大家的指导

作者
Author: pwzhou 时间: 2020-5-27 17:18
本帖最后由 pwzhou 于 2020-5-27 17:19 编辑

13366149259 发表于 2020-5-27 16:37
头大，上一条关于审稿意见的请教，没写完... 对不起，占用公众资源了。
下边是审稿人的意见：
“Further ...

个人理解，如果你不是发展方法而只是利用这些方法来做计算的话，那么你需要简单介绍一些这些方法，比如MBO是什么，大概是怎么算的，算出来的结果可以用来做什么，有什么优缺点之类的介绍，具体要根据你的文章来决定需要交代哪些背景知识。你可能文章里直接说我们用了什么方法，然后直接就说结果了，没有交代应有的背景知识，这个对于没做过或者不了解相关知识的人来说显得不友好。

作者
Author: 13366149259 时间: 2020-5-27 17:26

pwzhou 发表于 2020-5-27 17:18
个人理解，如果你不是发展方法而只是利用这些方法来做计算的话，那么你需要简单介绍一些这些方法，比如MB ...

非常感谢您的回复，我在文章也直接简单说了下DFT、MBO是啥，大家都用他来干啥，如下句子，是我在文中的简介。是我的介绍还不详细吗？有必要把他指出的3篇参考文献中的关于DFT、MBO的理论方程、由来等信息说详细吗？谢谢你
Compared with experimental investigation, density functional theory (DFT) is a powerful theory approach for understanding the thermodynamics and kinetics of reactions [26-28]. B3LYP is the three-parameterhybrid density model, which includes a mixture of Hatree-Fock exchange and DFT exchange correlation[29]. It is the most popular DFT method [30-34]. It has been applied to explain transformation mechanism of POPs[30]. The energetics, structure, and properties of molecules could be obtained through DFT calculations[26]. The Mayer bond order[35, 36] can be used to evaluate the strength of bonds of the molecular in the reactions[27].

作者
Author: pwzhou 时间: 2020-5-27 18:39

13366149259 发表于 2020-5-27 17:26
非常感谢您的回复，我在文章也直接简单说了下DFT、MBO是啥，大家都用他来干啥，如下句子，是我在文中的简 ...

你的是不够详细，但是不至于从理论方面详细讨论，如果都说的话你的Introduction得有多长。你的MBO就那么一句是不太够的，键级的算法应该有很多种，那么Mayer是怎么计算键级的，和其他计算键级的方法相比，这个方法有什么优势，你可以用几句话简单概括一下，大致就可以了，其他的也类似，另外也要根据你文章中具体的讨论看是不是需要加一些别的介绍。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2020-5-27 18:42

13366149259 发表于 2020-5-27 17:26
非常感谢您的回复，我在文章也直接简单说了下DFT、MBO是啥，大家都用他来干啥，如下句子，是我在文中的简 ...

你的文章跟用碳纳米管在生物体系里送东西有啥关系么？（我看你说是POP（持久有机污染物？）的转化机理）

作者
Author: 13366149259 时间: 2020-5-27 19:50

pwzhou 发表于 2020-5-27 18:39
你的是不够详细，但是不至于从理论方面详细讨论，如果都说的话你的Introduction得有多长。你的MBO就那么 ...

谢谢你

作者
Author: 13366149259 时间: 2020-5-27 19:55

liyuanhe211 发表于 2020-5-27 18:42
你的文章跟用碳纳米管在生物体系里送东西有啥关系么？（我看你说是POP（持久有机污染物？）的转化机理）

我的文章确实跟碳纳米管没有任何关系，我研究的持久性有机污染物。这个被指定的3篇文献，是审稿人提出来的。我估计是因为碳纳米管及其他两篇文章都用来DFT，这是跟我相似的地方，审稿人应该是让我参照上述3篇文章中DFT或MBO的描述，来完善我的文章吧。
所以我才有了疑问，因为上述3篇文献，大都从理论（方程、理论背景）角度，详细介绍了DFT，但我的论文只是采用了DFT作为工具，计算了MBO。所以我是否要详细的写出理论方程等内容，但万一真的是这样的话，我作为理论外行，就有点为难了，所以才发问的。
谢谢你

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-28 19:34
显然不是让你去把各种细节、原理都做详细解释，这必定会导致文章篇幅过长、主次不分。
只要把那些概念的基本特点通过几句话说一下，说明是干什么的、有什么意义、能得到什么信息，让外行读者也知道这些名词是指什么、本文为什么要用这些方法计算和分析，并且引用恰当的相关文献就够了。

作者
Author: 13366149259 时间: 2020-6-1 06:21

sobereva 发表于 2020-5-28 19:34
显然不是让你去把各种细节、原理都做详细解释，这必定会导致文章篇幅过长、主次不分。
只要把那些概念的基 ...

多谢老师指点~

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