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标题: CP2K CINEB 求助 [打印本页]

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Author: zhou9527 时间: 2020-6-1 16:47
标题: CP2K CINEB 求助
1、CP2K 做CINEB，其中控制插点数目的参数NUM_REPLICAS 是包含了初态和末态两个点的吗？那么为什么明明已经设置了不优化初态末态的点（OPTIMIZE_END_POINTS FALSE）, 可是需要的核数目仍然还是要设置成NPROC_REP * NUM_REPLICAS 呢？譬如我先在要在初态和末态之间插入5个Image,每个Image 用1个节点28个核计算(NPROC_REP 28)，那么不是只需要140和核就行吗,可是为什么实际必须要提供7*28 个核呢？

2、在不优化初态和末态的基础上，插入5个点，为什么在.out 文件里面显示用了5个image 5个replica 而不是3个image 5个replica; (VASP 里面image值得就是初态和末态之间的)

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Author: jiangning198511 时间: 2020-6-1 16:52
本帖最后由 jiangning198511 于 2020-6-1 16:54 编辑

看看这个例子 https://www.cp2k.org/exercises:2020_uzh_acpc2:ex03

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Author: zhou9527 时间: 2020-6-1 16:56

jiangning198511 发表于 2020-6-1 16:52
是中间的5个点，你可以先跑跑例子文件看看

谢谢您的回复，我仔细看过了，CP2K生成的*pos.xyz 文件，第一个和最后一个的坐标和提供的初态末态的坐标基本是一致的，难道是我体系的原因吗

作者
Author: zhou9527 时间: 2020-6-1 16:59

zhou9527 发表于 2020-6-1 16:56
谢谢您的回复，我仔细看过了，CP2K生成的*pos.xyz 文件，第一个和最后一个的坐标和提供的初态末态的坐标 ...

就是CP2K插的第一个点和最后一个点跟初态和末态的坐标基本是一样的

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Author: zhou9527 时间: 2020-6-1 17:01

jiangning198511 发表于 2020-6-1 16:52
看看这个例子 https://www.cp2k.org/exercises:2020_uzh_acpc2:ex03

哦哦，好的，谢谢谢谢

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Author: jiangning198511 时间: 2020-6-1 17:01

zhou9527 发表于 2020-6-1 16:59
就是CP2K插的第一个点和最后一个点跟初态和末态的坐标基本是一样的

看看这个例子 https://www.cp2k.org/exercises:2020_uzh_acpc2:ex03

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Author: jianying8996 时间: 2020-7-12 13:32
楼主你好，请问这个问题解决了吗？如何设置才能舍去始末态的结构优化？

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Author: jianying8996 时间: 2020-7-12 13:33
Number of Images 和 Number of Replicas:分别代表说什么？多谢赐教》》》

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Author: zhou9527 时间: 2020-7-12 21:21

jianying8996 发表于 2020-7-12 13:33
Number of Images 和 Number of Replicas:分别代表说什么？多谢赐教》》》

这个是CP2K的bug吧，初态和末态即使设置不优化，同样也需要吃相应的资源。官网解释前者表示在初态和末态的插点数目，后面表示所有的点。但是我计算的发现是一回事~~~

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Author: jianying8996 时间: 2020-7-14 10:47

zhou9527 发表于 2020-7-12 21:21
这个是CP2K的bug吧，初态和末态即使设置不优化，同样也需要吃相应的资源。官网解释前者表示在初态和末态 ...

对，我也发现相应的问题了，昨天试了一组，其实Number of Images 随便设置一个值，主要还是取决于计算节点和总核数，然后使input.inp中的Number of Replicas，images就是这两者的除数。

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