计算化学公社

标题: 请教NEWTON-X 结合Gaussian可以计算分子吸收光到达激发态的时间响应吗？ [打印本页]

作者
Author: NicoleJiao 时间: 2020-6-1 20:15
标题: 请教NEWTON-X 结合Gaussian可以计算分子吸收光到达激发态的时间响应吗？
老师们好，请教下，我想计算分子吸收光，从基态到达激发态的时间响应，以及相对于基态的电荷分布变化，请问，这可以用NEWTON-X结合Gaussian计算吗？

作者
Author: pwzhou 时间: 2020-6-1 21:10
分子吸收光到激发态是瞬间的，不知道你所指的时间响应具体是指啥？Newton-X可以算分子激发以后在激发态的一些过程的时间，比如激发态质子转移，通过势能面交叉的内转换等时间尺度在几十或者几百飞秒的过程（因为一般也就能跑个几百飞秒）。激发态和基态的电荷分布变化Gaussian可以直接算，不需要使用Newton-X。

作者
Author: abin 时间: 2020-6-1 21:23
理论模拟瞬态吸收光谱？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-2 08:07
激发态相对于基态电子密度分布的变化直接用Multiwfn作个密度差图便知
使用Multiwfn计算激发态之间的密度差
http://sobereva.com/429（http://bbs.keinsci.com/thread-10538-1-1.html）

如果你要获得电子密度分布变化的含时信息，用real time-TDDFT模拟，通过NWChem、Octopus可以做，这不是NEWTON-X的范畴，也不需要结合Gaussian。

作者
Author: NicoleJiao 时间: 2020-6-2 08:36

sobereva 发表于 2020-6-2 08:07
激发态相对于基态电子密度分布的变化直接用Multiwfn作个密度差图便知
使用Multiwfn计算激发态之间的密度差 ...

谢谢Sob老师，我去试试。

作者
Author: NicoleJiao 时间: 2020-6-2 08:41

abin 发表于 2020-6-1 21:23
理论模拟瞬态吸收光谱？

老师，是这样，我研究的体系是一个典型的D-A有机体，受光激发，电子从D→A。我想捕获电子从D到A的时间，做一个横坐标时间/纵坐标电子定位的图

作者
Author: NicoleJiao 时间: 2020-6-2 08:43

pwzhou 发表于 2020-6-1 21:10
分子吸收光到激发态是瞬间的，不知道你所指的时间响应具体是指啥？Newton-X可以算分子激发以后在激发态的一 ...

老师，我研究的体系是一个典型的D-A有机体，受光激发，电子从D→A。我想捕获电子从D到A的时间，做一个横坐标时间/纵坐标电子定位的图。Newton-X是能做激发态的失活过程时间，但是没法解决我的这个问题，是这样吗老师？

作者
Author: pwzhou 时间: 2020-6-2 09:43

NicoleJiao 发表于 2020-6-2 08:43
老师，我研究的体系是一个典型的D-A有机体，受光激发，电子从D→A。我想捕获电子从D到A的时间，做一个横 ...

如Sob所说，用real-time TDDF

作者
Author: abin 时间: 2020-6-2 09:46

NicoleJiao 发表于 2020-6-2 08:41
老师，是这样，我研究的体系是一个典型的D-A有机体，受光激发，电子从D→A。我想捕获电子从D到A的时间， ...

excited state dynamic之类的计算，可以模拟出来瞬态吸收光谱，
也可以解析出来你要的动态过程。
不过，就是解析过程需要费点力气。

作者
Author: 王寓于 时间: 2021-5-13 10:37
请问在把优化后的xyz格式用xyz2nx 转成 NEWTON-X format的时候一般会需要多长时间？我按教程上噻吩的例子练习时转了一个晚上既没有报错也没有任何文件生成。

作者
Author: NicoleJiao 时间: 2021-5-13 11:52

王寓于发表于 2021-5-13 10:37
请问在把优化后的xyz格式用xyz2nx 转成 NEWTON-X format的时候一般会需要多长时间？我按教程上噻吩的例子练 ...

记得是很快就能生成的

作者
Author: 王寓于 时间: 2021-5-13 21:27

NicoleJiao 发表于 2021-5-13 11:52
记得是很快就能生成的

您好，还有一个问题想咨询您一下。我在按手册第四章上面的噻吩做练习在执行 nxinp 设置初始条件的时候参数是按照教程给的设定的，但设置到中间就全都变了。比如下面图中执行完1以后并不会出现2的界面，而是出现别的第四章教程完全没有的参数让我设置，请问您遇到过这种情况吗？

作者
Author: Theor_Comp 时间: 2021-5-14 06:37

abin 发表于 2020-6-2 09:46
excited state dynamic之类的计算，可以模拟出来瞬态吸收光谱，
也可以解析出来你要的动态过程。
不 ...

请问用什么软件可以模拟瞬态谱呢？

作者
Author: abin 时间: 2021-5-14 07:43

Theor_Comp 发表于 2021-5-14 06:37
请问用什么软件可以模拟瞬态谱呢？

激发态动力学
比如NewtonX

作者
Author: biogon 时间: 2021-5-14 07:58

Theor_Comp 发表于 2021-5-14 06:37
请问用什么软件可以模拟瞬态谱呢？

但凡是个能算tddft的软件就能得到瞬态谱，如果说要获得演化过程就做激发态动力学

作者
Author: NicoleJiao 时间: 2021-5-14 08:43

王寓于发表于 2021-5-13 21:27
您好，还有一个问题想咨询您一下。我在按手册第四章上面的噻吩做练习在执行 nxinp 设置初始条件的时候参 ...

你好，也是没有完全跟教程上的参数完全一样，不过只是顺序调换了，这不影响使用，还是要看模拟结果的。

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