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标题: GAMESS-US EDA运行出错 [打印本页]

作者
Author: xiaobogaga 时间: 2015-9-22 08:29
标题: GAMESS-US EDA运行出错
我用GAMESS做EDA，总是提示我：DDI Process 23: error code 911 DDI Process 23: semget return DDI Process 15: semget return an error. semget errno=ENOSPC -- check system limit for sysv semaphores. DDI Process 1: semget ddikick.x: Fatal error detected.
请老师帮忙解答！！网上说是集群内存不够的原因，但是集群上都没有作业在运行。。。。。。。
还有就是，我用MP2/aug-cc-pvdz 做的时候，总是不收敛，请问是什么原因呢？我是新手，很多问题都不会，谢谢大家了！！

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-22 18:23
我就看了你的内存不够的输入文件，里面写得不合理，改成这样就没问题了。不要对轻原子用Lanl2DZ。
(, 下载次数 Times of downloads: 154)

(, 下载次数 Times of downloads: 35)

遇见报内存不够之类的问题时应先反复检查是否输入文件合理。

至于不收敛的，在上面的文件基础上把CCD替换成ACCD然后尝试

作者
Author: xiaobogaga 时间: 2015-9-22 20:20

sobereva 发表于 2015-9-22 18:23
我就看了你的内存不够的输入文件，里面写得不合理，改成这样就没问题了。不要对轻原子用Lanl2DZ。

谢谢sob老师，我马上试试

作者
Author: 白杨 时间: 2016-7-8 14:37
你的问题解决了吗？

作者
Author: 叫个啥名字呢 时间: 2020-7-1 21:43
哈哈，挖坟给大家说一下解决方法。
基本是问题原因，用这个命令就行了
需要root权限，for i in `ipcs -s | sed -n '4,$p' | cut -d" " -f2 ` ;do ipcrm -s $i ;done
gamess不正常结束内存会留存很多。

作者
Author: xiaobogaga 时间: 2020-7-7 17:27

叫个啥名字呢发表于 2020-7-1 21:43
哈哈，挖坟给大家说一下解决方法。
基本是问题原因，用这个命令就行了
需要root权限，for i in `ipcs -s ...

非常感谢您的分享！

作者
Author: YuhangJ 时间: 2020-9-12 09:29
非常感谢您的分享~

作者
Author: 413 时间: 2022-2-19 23:46
本帖最后由 413 于 2022-2-20 00:07 编辑

叫个啥名字呢发表于 2020-7-1 21:43
哈哈，挖坟给大家说一下解决方法。
基本是问题原因，用这个命令就行了
需要root权限，for i in `ipcs -s ...

补充：
不需要root权限，但是要登录到计算节点用这个命令。
复制过去经常会碰到单引号格式的问题，可以把命令拆开，写进脚本all=$(ipcs -s | sed -n '4,$p' | cut -d" " -f2)
echo $all
for i in $all ;do ipcrm -s $i ; done

也可以手动ipcrm -s

作者
Author: 星斗如盘 时间: 2022-10-25 20:30

413 发表于 2022-2-19 23:46
补充：
不需要root权限，但是要登录到计算节点用这个命令。
复制过去经常会碰到单引号格式的问题，可以 ...

非常好用，请问这个脚本是什么意思呢？

作者
Author: 星斗如盘 时间: 2022-10-25 20:31

叫个啥名字呢发表于 2020-7-1 21:43
哈哈，挖坟给大家说一下解决方法。
基本是问题原因，用这个命令就行了
需要root权限，for i in `ipcs -s ...

非常好用，请问这个脚本是什么意思呢？

作者
Author: 413 时间: 2022-10-31 10:24

星斗如盘发表于 2022-10-25 20:31
非常好用，请问这个脚本是什么意思呢？

大概的意思的清理gamess没有释放掉的内存

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