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标题: 求助对于荧光探针方面分子对接的疑问 [打印本页]

作者
Author: 逆火 时间: 2020-6-4 16:31
标题: 求助对于荧光探针方面分子对接的疑问
各位老师好，我是做荧光探针方面的学生，最近接触了一点分子对接，有一些疑问，烦请各位老师指教。
分子对接所研究的是配体和受体间的相互作用，请问发生反应属于这种相互作用吗？比如说，我有一种荧光探针和它检测的物质，这种探针会与检测物发生反应生成新物质。我可以用分子对接软件比如vina对探针与检测物做对接，然后用输出的affinity来判断探针与检测物的亲和度吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-4 17:06
分子对接程序只考虑受体和配体之间的弱相互作用
对于形成化学键的作用，不是分子对接程序里打分函数能描述的。应当做量子化学计算，计算反应前后的自由能变化，也可以用Multiwfn做波函数分析在一定程度上预测或者解释

作者
Author: 逆火 时间: 2020-6-5 09:29
明白了，谢谢老师。

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