计算化学公社

标题: 求助 MOFs材料跑分子动力学模拟 [打印本页]

作者
Author: 晓滨MD 时间: 2020-6-7 16:20
标题: 求助 MOFs材料跑分子动力学模拟
自己根据文献合成的ZIF-8(Zn)MOFs材料，请教一下各位老师，是否能用gromacs进行分子动力学模拟，选用哪个力场比较合适，MOFs材料的分子动力学模拟对于原子电荷有没有要求？

作者
Author: snljty 时间: 2020-6-7 19:44
可以试试GFN-FF?

作者
Author: 晓滨MD 时间: 2020-6-7 21:16

snljty 发表于 2020-6-7 19:44
可以试试GFN-FF?

可以在gromacs里面完成吗？

作者
Author: 晓滨MD 时间: 2020-6-7 21:21

snljty 发表于 2020-6-7 19:44
可以试试GFN-FF?

老师，是这个 CHARMM General force field吗？

作者
Author: 土拔鼠 时间: 2020-6-7 21:59

晓滨MD 发表于 2020-6-7 21:21
老师，是这个 CHARMM General force field吗？

应该是新版本xtb里面支持的方法

作者
Author: 土拔鼠 时间: 2020-6-7 22:00

snljty 发表于 2020-6-7 19:44
可以试试GFN-FF?

如果是MOFs和蛋白的相互作用是不是目前也没有比较好的力场能同时描述啊

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-8 15:55

晓滨MD 发表于 2020-6-7 21:21
老师，是这个 CHARMM General force field吗？

http://bbs.keinsci.com/thread-17302-1-1.html

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