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标题: win10 WSL下运行高斯G16, 速度很慢，求助可能的原因 [打印本页]

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Author: ls1248 时间: 2020-6-11 07:40
标题: win10 WSL下运行高斯G16, 速度很慢，求助可能的原因
大家好，我之前有通过win应用商店在win10里装wsl下Ubuntu 20.04(默认在系统C盘)，运行g16算东西还可以，后来系统盘不够，就卸载了，重新在D盘装了wsl-Ubuntu，觉得很慢，之前3分钟算完的job，D盘这边要算100min（用同样的输入文件），奇怪的是输出文件里 job cpu time 还是3min。
C，D盘同属一块SSD。拷文件测试了速度，在win下和wsl-Ubuntu下相差不多。
WSL重新装回系统C盘再算，也快不了了（也要100多分钟），郁闷。
-M- 2GB
-P- 4 都一样。

各位有没有类似的经历，实际电脑算的时间和log文件里的cup time区别很大。请大家指点可能的原因和思路。
---------更新：-----------
发现比之前算的时候好像多了两个连号pid：
之前我记得没有sh和g16这两个进程

----------gmf 再更新：------
又跑的一个任务，out文件生成时间与最后写入时间信息与其内容：（elapsed time 33min < real time 50min, why?）

作者
Author: zsu007 时间: 2020-6-11 07:50
计算时间的差异可能C盘是固态硬盘，D盘是机械硬盘的缘故。

作者
Author: ls1248 时间: 2020-6-11 08:02

zsu007 发表于 2020-6-11 07:50
计算时间的差异可能C盘是固态硬盘，D盘是机械硬盘的缘故。

C，D盘同属一块SSD。拷文件测试了速度，在win下和wsl-Ubuntu下相差不多。

作者
Author: ls1248 时间: 2020-6-11 08:07

zsu007 发表于 2020-6-11 07:50
计算时间的差异可能C盘是固态硬盘，D盘是机械硬盘的缘故。

并且，top命令看到的时间100多分钟，然而 log文件里写的cpu time 只有3min多

作者
Author: zsu007 时间: 2020-6-11 08:56

ls1248 发表于 2020-6-11 08:02
C，D盘同属一块SSD。拷文件测试了速度，在win下和wsl-Ubuntu下相差不多。

这么说来，高斯计算还是在Linux环境下好使！

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-6-11 09:20

ls1248 发表于 2020-6-11 08:07
并且，top命令看到的时间100多分钟，然而 log文件里写的cpu time 只有3min多

可能是运算的时候写的核心数超过了实际物理核心数吧，在写输入文件的时候%nprocshared=n，n不能大于物理核心数。不然会很慢，这是老生常谈的问题了。
top命令查看的是cpu时间，就是比如你写%nprocshared=20，满载运行了5min这里显示的是就是1：40：00。因为高斯运行不同模块用的进程号是一个。

作者
Author: ls1248 时间: 2020-6-11 13:39

喵星大佬发表于 2020-6-11 09:20
可能是运算的时候写的核心数超过了实际物理核心数吧，在写输入文件的时候%nprocshared=n，n不能大于物理 ...

问题描述里有说，其它条件都没变。 <-M- 2GB -P- 4> 没有变过。实际跑的时间也差不多100/4=25min，top怎么算都远大于3min

作者
Author: hebrewsnabla 时间: 2020-6-11 13:43
上传输入输出文件看看？

作者
Author: ls1248 时间: 2020-6-11 13:43

喵星大佬发表于 2020-6-11 09:20
可能是运算的时候写的核心数超过了实际物理核心数吧，在写输入文件的时候%nprocshared=n，n不能大于物理 ...

并且核心4个也没超，我各种测试，控制变量，死活找不到原因。

作者
Author: ls1248 时间: 2020-6-11 14:34

hebrewsnabla 发表于 2020-6-11 13:43
上传输入输出文件看看？

这个电脑上没有，但最新有个发现，我传了一个top截图，你看看正常不，3个进程一直存在，之前我记得好像只有一个。

作者
Author: 叫个啥名字呢 时间: 2020-6-11 17:37
1.win10现在WSL更新到WSL2了，原来WSL好像是真实的主机，到了WSL2是虚拟的了。
2.是不是现在运行Gaussian的时候你在win里面也运行其他东西，WSL实际可支配CPU时间有一部分其实是分配给了win.

作者
Author: ls1248 时间: 2020-6-12 01:30

叫个啥名字呢发表于 2020-6-11 17:37
1.win10现在WSL更新到WSL2了，原来WSL好像是真实的主机，到了WSL2是虚拟的了。
2.是不是现在运行Gaussian ...

e有这个可能，不过，外边只开也chrome浏览器，用的是wsl1.
另外就算分给别的win进程一些时间片， elapsed time 不也应该和实际 out文件的创建-最后写入时间差接近吗？

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