计算化学公社

标题: 求助体系的轨迹叠加图的绘制 [打印本页]

作者
Author: 明园 时间: 2020-6-11 14:46
标题: 求助体系的轨迹叠加图的绘制
卢老师，之前我发了一个帖子问过您可否用RMSD验证两个体系的稳定度，您说：最好绘制一个比如1000帧的轨迹叠加图（事先先做align消除平动和转动），从这样的图可以直观看出来波动的大小。
请问老师，有没有具体的帖子可以供参考一下，谢谢老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-11 22:17
在此基础上举一反三：
绘制范德华势论文中动力学模拟过程中原子位置叠加图的做法介绍
http://bbs.keinsci.com/thread-17446-1-1.html

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)