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标题: 如何计算AIMD过程的化学键数目? [打印本页]

作者
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yiranfengbai    时间: 2020-6-19 14:53
标题: 如何计算AIMD过程的化学键数目?
各位老师,我用VASP计算了复合物AB层模型10p's的AIMD,我希望能得到10ps内,A-B、A-A、B-B化学键数目随时间的变化,应该怎么做呢?
是使用哪个软件或者写脚本什么的?
这是参考论文中的图
(, 下载次数 Times of downloads: 38)

作者
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sobereva    时间: 2020-6-19 18:36
自己写个VMD的tcl脚本统计,撑死了超不过20行就能解决
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agent99    时间: 2020-6-20 01:46
如果化学键是根据原子间距离定义的话就很容易吧
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yiranfengbai    时间: 2020-6-20 09:59
sobereva 发表于 2020-6-19 18:36
自己写个VMD的tcl脚本统计,撑死了超不过20行就能解决

好的,谢谢社长
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yiranfengbai    时间: 2020-6-20 10:01
agent99 发表于 2020-6-20 01:46
如果化学键是根据原子间距离定义的话就很容易吧

是根据原子间距定义的




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