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标题: 振動光譜可否拆解？ [打印本页]

作者
Author: sdd3390 时间: 2020-6-22 19:55
标题: 振動光譜可否拆解？
各位好

假設我有A和B兩個分子
我想比較在沒有A分子時和A分子靠近B分子時 B分子振動光譜的變化
因為Gaussian在計算振動光譜時是A和B同時計算
有辦法將計算出的振動光譜拆解成A分子和B分子分別的貢獻嗎?

作者
Author: biogon 时间: 2020-6-22 21:29
试试复合物冻结一个分子算振动光谱，但是这样振动分析必然有虚频，不知道结果是否可靠

作者
Author: doublezhang 时间: 2020-6-22 21:36
gaussian 频率分析输出文件里是每个原子的每个振动的坐标吧，我记得。
你只要勤快一点，手动把它们拆开……

作者
Author: pyscf 时间: 2020-6-22 21:47
10.1021/acs.jctc.7b01171 这篇文章的方法不知道是不是你想要的

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-23 00:34
Gaussian没法严格这么做。有些程序支持有效势，在一定程度上可以达到这个目的

作者
Author: sdd3390 时间: 2020-6-23 05:59
感謝各位先進的回答
我曾經想用ONIOM辦到這件事
但是卡在ONIOM中 high low level 之間必須有link atom
但我的系統中 A和 B 分子之間並無任何 link atom
能否讓ONIOM 不去檢查 link atom 然後計算? 要不就只能試試 ORCA的 QM/MM模組了

作者
Author: pyscf 时间: 2020-6-23 09:50

sdd3390 发表于 2020-6-23 05:59
感謝各位先進的回答
我曾經想用ONIOM辦到這件事
但是卡在ONIOM中 high low level 之間必須有link atom

四楼提到的gsva方法就是基于subsystem的而且有现成的程序可以用
https://github.com/zorkzou/UniMoVib

作者
Author: sdd3390 时间: 2020-6-23 14:07
感謝 pyscf 提供的資訊很有幫助

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