计算化学公社

标题: 一个无聊的测试，多核心高主频未必快 [打印本页]

作者
Author: abin 时间: 2020-6-23 20:23
标题: 一个无聊的测试，多核心高主频未必快
hostA E-5 2692 v2 @ 2.20 GHz

hostB
E-5 2696 v3 @ 2.30 GHz

同样的ADF2019软件,GGA/PBE, DFT计算。

在hostA处理器上采用一个物理处理器，也就是12核心；
在hostB处理器上采用一个物理处理器，也就是18核心；
都是本地读写缓存，hostA是机械硬盘，hostB是机械硬盘做RAID0。

结论是，
在hostA上，采用12核心，算得比hostB上的18核心更快。

比如，同一个GGA/PBE计算，hostA需要72分钟，hostB需要150分钟。

以上测试，仅仅针对，每个计算都独占一颗处理器的情形。

明星处理器还是很牛逼的。

如果是去淘宝捡破烂的话，淘一个E-5 2692 v2应该很合算的。

作者
Author: biogon 时间: 2020-6-23 20:46
我觉得更大可能是软件的问题

作者
Author: 刘小英雄steven 时间: 2020-6-23 21:54
那应该用啥指标去测服务器的性能呢？

作者
Author: shalene 时间: 2020-6-23 22:20
改变了俩变量，不能得出如题的结论

作者
Author: granvia 时间: 2020-6-23 22:35
内存有没有试过？有的CPU需要最佳的内存配置（包括内存条的大小和数目）才能发挥出最高效率

作者
Author: abin 时间: 2020-6-23 23:35

granvia 发表于 2020-6-23 22:35
内存有没有试过？有的CPU需要最佳的内存配置（包括内存条的大小和数目）才能发挥出最高效率

没有。
这只是一个突发事故，在某一次查看数据时候，
发现同一个计算，居然分别放在了两个平台上做计算，
就顺手看了下计算时间。

hostA, 一个CPU核心配备2GB内存，合计两颗处理器，48GB内存，并没有开启所有内存通道。
开启8个内存通道，需要8个内存条；实际上机器中，只有6个8GB内存条。

hostB，两颗处理器，配置8*8GB内存，按照主板说明书，应该是开启了所有8个内存通道。

SCM ADF官方有说明，他们的程序并行效率很不错，可以轻松达到50核心以上；如果有好的网络，数百CPU效率也不错。

E5 2692 v2是神一般的处理器。

作者
Author: indec 时间: 2020-6-24 02:23

abin 发表于 2020-6-23 23:35
没有。
这只是一个突发事故，在某一次查看数据时候，
发现同一个计算，居然分别放在了两个平台上做计 ...

B 这大概率是单物理核内存不够的原因。ADF 推荐单物理核给 4GB 内存，遇到部分大体系或者较高水平计算，可以给到 8GB/core 。同时，缓存盘容量也是一个决定因素。

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2020-6-24 07:16
结果反常，而且原因不明

估计是v3的机器没有配置好

作者
Author: bobosiji 时间: 2020-6-24 15:13
为啥说 E-5 2692 v2 是明星处理器呢？天河二号似乎就是这个CPU

作者
Author: abin 时间: 2020-6-24 16:29

bobosiji 发表于 2020-6-24 15:13
为啥说 E-5 2692 v2 是明星处理器呢？天河二号似乎就是这个CPU

这个处理器，当年发售的时候，市面上基本买不到。
属于特殊定制的一款，所以当年的天河才能在Top500名列前茅。

现在能否在淘宝上买到，不晓得。
有兴趣的可以自己找找。
其他不了解。

作者
Author: 牧生 时间: 2020-6-25 09:40
本帖最后由牧生于 2020-6-25 09:43 编辑

我以前的测试，主频高的，速度快，

但是核数多，却不一定快，比如6149的双路（开启超线程），粗粒化，1.44万珠子，6核大约140 小时完成50 ns，8核大约120小时完成50 ns，16核大约100小时完成 50 ns。。

所以，我现在都是8核计算，同时运行7~8个任务。

作者
Author: abin 时间: 2020-6-25 11:47

牧生发表于 2020-6-25 09:40
我以前的测试，主频高的，速度快，

但是核数多，却不一定快，比如6149的双路（开启超线程），粗粒化，1. ...

了解你的说法。

ADF的官方号称，他们的程序，100多个CPU，并行效率也是十分棒。

结果，我就十分简单粗暴地在双路服务器上，
直接独占一颗CPU来做计算，然后结果出乎意料。

没工夫探讨具体原因。

结论就是，学生会反馈，
新机器算ADF好慢。

作者
Author: abin 时间: 2020-6-25 19:52

abin 发表于 2020-6-24 16:29
这个处理器，当年发售的时候，市面上基本买不到。
属于特殊定制的一款，所以当年的天河才能在Top500名 ...

找一个中文的页面看看吧。

https://item.taobao.com/item.htm ... p;abbucket=9#detail

作者
Author: xiaomidaxue 时间: 2020-7-8 12:00
原则上不太可能，因为决定cpu运算速度的是主频、核数和架构。
V3的架构肯定是优于V2，且主频高，核数多（且ADF支撑多核心运算）。并且V3的内存是ddr4，V2的内存只支撑ddr3，内存上ddr4要快于ddr3较多。
所以，建议你用V3的12核再进行测试，看看结果。

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