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标题: 有机分子三重态激发态计算求助 [打印本页]

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zoey    时间: 2020-6-27 19:55
标题: 有机分子三重态激发态计算求助
老师好,刚接触一个涉及激发态的课题,需要计算有机分子三重态时激发态的能量,第一次算激发态有很多不懂的地方。在计算上文献提到:“We studied the energetics of 3a(singlet) and 3a* (triplet) computationally using the B3LYP/6-311+G(2d,p) method” ,不太明白3a的singlet和3a*的triplet优化计算怎么处理的
3a的singlet优化是 # opt  B3LYP/6- 311+G(2d,p) freq  电荷0 自旋多重度1
3a*的triplet优化是# opt uB3LYP/6- 311+G(2d,p) td freq    电荷0 自旋多重度3
如上设置关键词合适吗?3a*的triplet优化B3LTP能加U吗?

其次,文献提到“Thecomputed energy gap (58.5 kcal mol−1) was lower than thetriplet energy of Ir*[dF(CF3)ppy]2(dtbbpy)+ (60.1 kcalmol−1), suggesting that energy transfer from the catalyst tothe substrate was feasible” energy gap应该是指上面3a的singlet和3a*的triplet的差,是不是3a的singlet优化时需要加td才能和3a*的triplet相比较?


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喵星大佬    时间: 2020-6-27 21:12
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-6-27 21:24 编辑

优化激发态结构不需要写td,只要你自旋写的不是1程序会默认用udft所以写不写ub3lyp无所谓
不用加弥散函数,想要更高精度可以统一用def2tzvp
再就是优化激发态结构的时候B3LYP不算稳妥,PBE0(Gaussian里写pbe1pbe,直接写pbe0是个巨坑),M06-2X或者wB97XD比较好
输入文件写作
#p opt pbe1pbe 6-311G**

Title

0  3
坐标略

这样就可以了
用TDDFT方法优化过渡态结构也可以要用td(triplet)关键字
#p opt pbe1pbe  6-311G**  td(triplet)

Title

0  1
坐标略
就可以了,但是结果和上面的没区别,耗时倒是会增加几倍,属于比较2的做法。
作者
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liyuanhe211    时间: 2020-6-28 05:27
本帖最后由 liyuanhe211 于 2020-6-28 10:26 编辑

这儿都有答案:http://sobereva.com/314
另外2L说的有几点错误,比如“但是(TD)结果和上面的(△SCF)没区别”是错误的,具体看上文就知道了。
作者
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sobereva    时间: 2020-6-28 19:16
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“激发态计算”改了,以后务必注意

td结合0 3优化的根本不是T1,得到的是什么根本没法预料
怎么优化T1态这里都写明了,仔细阅读,别乱用关键词
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html

把文献里的段落粘过来的时候注意缺失空格的问题,这造成别人阅读费劲。


作者
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zoey    时间: 2020-6-29 18:32
喵星大佬 发表于 2020-6-27 21:12
优化激发态结构不需要写td,只要你自旋写的不是1程序会默认用udft所以写不写ub3lyp无所谓
不用加弥散函数 ...

多谢指导
作者
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zoey    时间: 2020-6-29 18:33
liyuanhe211 发表于 2020-6-28 05:27
这儿都有答案:http://sobereva.com/314
另外2L说的有几点错误,比如“但是(TD)结果和上面的(△SCF)没 ...

谢谢 提供的资料
作者
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zoey    时间: 2020-6-29 18:35
sobereva 发表于 2020-6-28 19:16
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反 ...

好的,标题和粘贴问题以后会注意

谢谢Sob老师
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yiwind    时间: 2023-2-11 14:27
我得到了 三重态的结构,现在想计算三重态的单点能,自选多重度是设置 “0 1”还是设置为“0 3”呀?
作者
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zjxitcc    时间: 2023-2-11 15:44
yiwind 发表于 2023-2-11 14:27
我得到了 三重态的结构,现在想计算三重态的单点能,自选多重度是设置 “0 1”还是设置为“0 3”呀?

(1)是自旋,不是自选;
(2)说清楚要用什么理论方法算,以及基态是否为闭壳层单重态
作者
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柚子    时间: 2023-4-18 16:10
zjxitcc 发表于 2023-2-11 15:44
(1)是自旋,不是自选;
(2)说清楚要用什么理论方法算,以及基态是否为闭壳层单重态

老师您好,请问如果基态为闭壳层单重态,DFT,若要计算T1态的单点能,自旋多重度是“0 1”还是“0 3”呢?
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2023-4-18 16:31
柚子 发表于 2023-4-18 16:10
老师您好,请问如果基态为闭壳层单重态,DFT,若要计算T1态的单点能,自旋多重度是“0 1”还是“0 3”呢 ...

有两种计算方式,以高斯为例:
(1)UDFT计算,坐标上面一行的自旋多重度写3,不要搭配TD关键词;
(2)TDDFT计算,坐标上面一行的自旋多重度写1,搭配TD(triplet)关键词。
作者
Author:
柚子    时间: 2023-4-18 17:09
zjxitcc 发表于 2023-4-18 16:31
有两种计算方式,以高斯为例:
(1)UDFT计算,坐标上面一行的自旋多重度写3,不要搭配TD关键词;
(2 ...

感谢老师的回答。
这两种方法我都做了,但是两个能量相差较大。研究对象是一个TADF分子,计算得到的S1态能量为40kcal/mol,我是以基态单重态的能量为基准,用UDFT得到的能量为33kcal/mol,用TDDFT得到的能量为40kcal/mol。
请问老师这种情况下怎么选择呢?
作者
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wzkchem5    时间: 2023-4-18 17:15
柚子 发表于 2023-4-18 10:09
感谢老师的回答。
这两种方法我都做了,但是两个能量相差较大。研究对象是一个TADF分子,计算得到的S1态 ...

建议用高精度方法算单点能,例如双杂化泛函、CC2、ADC(2)、DLPNO-STEOM-CCSD、NEVPT2等
作者
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柚子    时间: 2023-4-19 09:21
wzkchem5 发表于 2023-4-18 17:15
建议用高精度方法算单点能,例如双杂化泛函、CC2、ADC(2)、DLPNO-STEOM-CCSD、NEVPT2等

谢谢老师的建议,我尝试一下。
作者
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symbolhone    时间: 2023-6-1 09:29
wzkchem5 发表于 2023-4-18 17:15
建议用高精度方法算单点能,例如双杂化泛函、CC2、ADC(2)、DLPNO-STEOM-CCSD、NEVPT2等

wzkchem5老师,您好。我最近在用双杂化泛函计算TADF分子ΔEST,我是先用gaussian做的opt,然后再用ORCA做的双杂话泛函计算,其中一个分子,它的out里显示这样:
TD-DFT/TDA EXCITED STATES (SINGLETS)
STATE  1:  E=   0.099942 au      2.720 eV    21934.7 cm**-1 <S**2> =   0.000000
STATE  2:  E=   0.116849 au      3.180 eV    25645.5 cm**-1 <S**2> =   0.000000
STATE  3:  E=   0.126277 au      3.436 eV    27714.6 cm**-1 <S**2> =   0.000000

TD-DFT/TDA EXCITED STATES (TRIPLETS)
STATE  1:  E=   0.102962 au      2.802 eV    22597.6 cm**-1 <S**2> =   2.000000
STATE  2:  E=   0.096927 au      2.638 eV    21273.0 cm**-1 <S**2> =   2.000000
STATE  3:  E=   0.114811 au      3.124 eV    25198.2 cm**-1 <S**2> =   2.000000

其中STATE  1 (TRIPLETS)的能量是2.802eV, STATE  2 (TRIPLETS)则是2.638eV,这个是什么原因导致的呢,出现这种情况是不是意味着我这个计算任务就需要重新进行呢。

作者
Author:
wzkchem5    时间: 2023-6-1 16:56
symbolhone 发表于 2023-6-1 02:29
wzkchem5老师,您好。我最近在用双杂化泛函计算TADF分子ΔEST,我是先用gaussian做的opt,然后再用ORCA做 ...

这是因为双杂化泛函TDDFT计算是先求解Casida方程,再加doubles correction。双杂化泛函TDDFT的激发能虽然应该读包括了doubles correction的值,但是是按Casida方程的解的大小顺序排序的,而不是按包括了doubles correction的值的大小顺序排序的。所以如果只看最终的激发能的话,可能不是单调递增的,这是正常现象。此时应该把你的STATE 2叫T1,把你的STATE 1叫T2。
作者
Author:
symbolhone    时间: 2023-6-1 21:53
wzkchem5 发表于 2023-6-1 16:56
这是因为双杂化泛函TDDFT计算是先求解Casida方程,再加doubles correction。双杂化泛函TDDFT的激发能虽然 ...

好的我明白了,我仔细查看了out文件,找到了相关的部分。感谢老师您的解答。
作者
Author:
lzy5260    时间: 2025-11-23 11:36
喵星大佬 发表于 2020-6-27 21:12
优化激发态结构不需要写td,只要你自旋写的不是1程序会默认用udft所以写不写ub3lyp无所谓
不用加弥散函数 ...

请问你写的那个进行T1的结构优化了吗?还是说把下面2步合成一步了
1 优化T1结构:# B3LYP/6-31G* opt,电荷和自旋多重度为0 3。
2 取上一步优化得到的结构,用# B3LYP/6-31G* TD(triplet),电荷和自旋多重度为0 1。第一激发态的激发能就是磷光发射能了。
我刚学不太懂,望解答下,谢谢

作者
Author:
wzkchem5    时间: 2025-11-23 12:01
lzy5260 发表于 2025-11-23 11:36
请问你写的那个进行T1的结构优化了吗?还是说把下面2步合成一步了
1 优化T1结构:# B3LYP/6-31G* opt, ...

只做# B3LYP/6-31G* opt(自旋多重度3)确实得不到磷光发射能。为了得到磷光发射能,用# B3LYP/6-31G* TD(triplet)(自旋多重度1)是一种做法,也可以用# B3LYP/6-31G* opt(自旋多重度3)的能量减去# B3LYP/6-31G* opt(自旋多重度1)的能量。当泛函趋于精确时,两者结果趋于等价,但对于一般的近似泛函两者不等价。此外后一种做法还有一个缺点:难以得到磷光速率。
除此之外还有第三种方法:# B3LYP/6-31G* opt TD(triplet),一个输入文件搞定,缺点是耗时长,结构优化收敛可能困难,且结果未必比前两种更准。
至于什么情况下用哪种方法更好,参见https://mattermodeling.stackexch ... -triplets/9357#9357
作者
Author:
lzy5260    时间: 2025-11-23 15:53
wzkchem5 发表于 2025-11-23 12:01
只做# B3LYP/6-31G* opt(自旋多重度3)确实得不到磷光发射能。为了得到磷光发射能,用# B3LYP/6-31G* TD ...

谢谢老师
我理解是你的那一步只是优化了T1
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2025-11-24 10:21
lzy5260 发表于 2025-11-23 15:53
谢谢老师
我理解是你的那一步只是优化了T1

计算磷光发射能,需要在优化的T1结构下计算T1能量和S0能量之差。
如果你优化T1的方法本身就能给出T1能量和S0能量之差,那么只需跑优化T1这一个计算,一个计算管两件事。至于准不准是另一码事
作者
Author:
lzy5260    时间: 2025-11-24 10:40
wzkchem5 发表于 2025-11-24 10:21
计算磷光发射能,需要在优化的T1结构下计算T1能量和S0能量之差。
如果你优化T1的方法本身就能给出T1能量 ...

谢谢老师




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