计算化学公社

标题: 请问如何比较材料的水溶性 [打印本页]

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-9-29 13:49
标题: 请问如何比较材料的水溶性
如题
通过高斯计算哪些参数可以比较两种相似结构（如乙醇和丙醇）的亲水性呢？
谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2015-9-30 00:12
其实就是计算LogP。预测LogP的方法很多，大多都是基于一些量化能算出来的量，然后建立QSPR方程来预测，搜文献能搜出好多，然后你去用量化来算出那些量就行了。
比如分子表面静电势极大、极小点数值，分子表面静电势的方差（衡量静电势的波动程度），偶极矩，分子极性/非极性表面积，等等等等。原子电荷也能和这有关，比如烷烃，整个体系中不同原子的电荷差异不大，显然不会有明显的局部极性，和水的静电相互作用就会弱。

更直接的就是计算分子在水中的溶解自由能，用带着scrf=SMD关键词得到的能量减去气相下的能量即是。溶解自由能越负越亲水。

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-9-30 08:27

sobereva 发表于 2015-9-30 00:12
其实就是计算LogP。预测LogP的方法很多，大多都是基于一些量化能算出来的量，然后建立QSPR方程来预测，搜文 ...

谢谢老师

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-9-30 13:45

sobereva 发表于 2015-9-30 00:12
其实就是计算LogP。预测LogP的方法很多，大多都是基于一些量化能算出来的量，然后建立QSPR方程来预测，搜文 ...

sob老师，请问您说的这个偶极矩用啥关键词啊？polarity吗？结果中直接可以显示整个分子的偶极矩数值还是对结果进行手动计算呢？
谢谢老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-10-1 04:26

lastzealot 发表于 2015-9-30 13:45
sob老师，请问您说的这个偶极矩用啥关键词啊？polarity吗？结果中直接可以显示整个分子的偶极矩数值还是 ...

高斯输出文件末尾就有偶极矩，默认输出的

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-10-1 09:39

sobereva 发表于 2015-10-1 04:26
高斯输出文件末尾就有偶极矩，默认输出的

哦，找到了，就是在那一大堆文字中间
谢谢老师

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-10-1 10:43

sobereva 发表于 2015-10-1 04:26
高斯输出文件末尾就有偶极矩，默认输出的

但是我发现怎么有三个数值啊？
Dipole=-0.1767526,0.4973648,-1.2552657
请问这三个数都是什么意思？哪个是整个分子的偶极矩呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-10-1 13:33
偶极矩是矢量，给出的自然是XYZ分量。
偶极矩的大小在输出文件里也有，或者你自己手动计算偶极矩矢量的模。

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-10-1 23:19

sobereva 发表于 2015-10-1 13:33
偶极矩是矢量，给出的自然是XYZ分量。
偶极矩的大小在输出文件里也有，或者你自己手动计算偶极矩矢量的模 ...

谢谢老师

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