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标题: 求助gromacs如何统计向量夹角分布 [打印本页]

作者
Author: zhangzh 时间: 2020-7-3 22:48
标题: 求助gromacs如何统计向量夹角分布
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如图，在这个工作中把主体分子的两个氧原子之间连线定义为向量p和q，然后将p，q与法向量n的夹角定义为α和β。我在实验中也有类似的需求，请问一下如何在gromacs中自定义类似的向量，并给出夹角或模长的分布呢？

作者
Author: liuyuje714 时间: 2020-7-3 22:57
gmx gangle

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-4 05:26
自行写个VMD的分析脚本就完了，最多不超过30行

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