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标题: 分析RDG填色图遇到的问题 [打印本页]

作者
Author: qianbao 时间: 2020-7-4 10:54
标题: 分析RDG填色图遇到的问题
老师好，我在学习http://sobereva.com/68帖子时，想用RDG填色图分析一下分子内的相互作用，但是不会去使用和分析
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左图（1-1）中间和右图（2-1）中间区域对比，右图就有很明显的红色，可以说明绿色区域是范德华作用吗
请问老师，还可以用这个色卡图来分析吗？
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谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-4 15:29
RDG平面图的色彩刻度体现的是RDG的数值，而sign(lambda2)rho着色的RDG等值面图的色彩体现的是sign(lambda2)rho的数值，完全是两码事，根本没有任何可比性。你平面图里的颜色显然和sign(lambda)2rho的色彩刻度毫无联系。

作者
Author: qianbao 时间: 2020-7-8 09:12

sobereva 发表于 2020-7-4 15:29
RDG平面图的色彩刻度体现的是RDG的数值，而sign(lambda2)rho着色的RDG等值面图的色彩体现的是sign(lambda2) ...

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老师，那RDG数值可以按照这个来分析吗？两个分子内的不一样可以认为是化学键的强弱不同导致的吗？也就是在单分子内RDG数值的大小可以认为是化学键的强弱不同？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-9 07:15

qianbao 发表于 2020-7-8 09:12
老师，那RDG数值可以按照这个来分析吗？两个分子内的不一样可以认为是化学键的强弱不同导致的吗？也就 ...

我不知道你想说明什么
RDG和化学键强度毫无直接关系。要用实空间函数分析也是应当用ELF、LOL、价层电子密度、变形密度之类的函数分析，仔细看
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471（http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html）

作者
Author: qianbao 时间: 2020-7-9 13:14

sobereva 发表于 2020-7-9 07:15
我不知道你想说明什么
RDG和化学键强度毫无直接关系。要用实空间函数分析也是应当用ELF、LOL、价层电子 ...

老师，我是想根据这两个图形的对比做一下分析，但是我理解的是RDG数值是代表相互作用，这个图可以说明的是相互作用的区域，但是否还有其他意义？
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然后根据这个，我也没有会分析。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-10 05:37

qianbao 发表于 2020-7-9 13:14
老师，我是想根据这两个图形的对比做一下分析，但是我理解的是RDG数值是代表相互作用，这个图可以说明 ...

RDG只能展现可能存在的相互作用区域，既不能体现相互作用类型，也不能体现相互作用强度

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