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标题: 红外光谱对脲羰基和氨脂羰基位置的判定求助 [打印本页]

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dakedidi    时间: 2020-7-7 09:32
标题: 红外光谱对脲羰基和氨脂羰基位置的判定求助
本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-9 10:02 编辑

新人提问:
采用R-NCO(异氰酸酯基团)和R-NH(亚胺基)生产脲基结构,脲基结构中含有脲羰基,实测红外位置在1650 cm-1左右的位置,但是高斯计算并用Multiwfn调整后得到的结果是1710cm-1(此处对应氨脂基团的羰基),请各位老师帮忙指点。



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bomsaude    时间: 2020-7-7 15:41
你单独计算一个分子的话,是不能反映分子的真实情况的。测定实际分子的红外时,脲基是通过之间的氢键键合的,反映在红外上1650波数的位置是amide I 区域,是个大鼓包,可以分成几个峰,根据氢键键合的程度从大到小,波数由低到高。你如果就拿一个单独分子计算的话,波数应该偏大。
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sobereva    时间: 2020-7-8 03:25
问题的细节不够充分
实验是在什么状态下测的,液态、晶体还是溶液需要说明,而且没有你的计算的关键词也不好说是否计算上有问题
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dakedidi    时间: 2020-7-9 09:57
本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-9 10:23 编辑
sobereva 发表于 2020-7-8 03:25
问题的细节不够充分
实验是在什么状态下测的,液态、晶体还是溶液需要说明,而且没有你的计算的关键词也不 ...

感谢sob老师回复,我就是对298K下的结构进行优化,是个单纯一个有机分子,无溶液,关键词是#p opt freq 6-31g(d) b97d,想要分析红外的结构见我原始提问下面的脲羰基所示。实测脲羰基C=O震动红外位置在1650 cm-1左右的位置,可是频率计算得到的是在1710cm-1位置,请问有什么解决办法吗。sob老师,我知道高斯计算的值偏大,但是问题是,就算调整缩减比例以后也对不上。

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dakedidi    时间: 2020-7-9 10:06
本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-9 10:24 编辑
bomsaude 发表于 2020-7-7 15:41
你单独计算一个分子的话,是不能反映分子的真实情况的。测定实际分子的红外时,脲基是通过之间的氢键键合的 ...

非常感谢bom老师的回复!!我重新编辑了下帖子,把分析模型和红外的结果粘上了。我用gv查看vibration的时候能够看到明显的C=O伸缩振动及对应的强度值,这里的C=O振动只对应了一个独立而且很的的强度,没有分峰。bom老师,我知道高斯计算的值偏大,但是问题是,就算调整缩减比例以后也对不上。请问bom老师,后续我应该如何操作,麻烦给支个招!感谢感谢感谢!
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sobereva    时间: 2020-7-10 05:30
dakedidi 发表于 2020-7-9 09:57
感谢sob老师回复,我就是对298K下的结构进行优化,是个单纯一个有机分子,无溶液,关键词是#p opt freq 6 ...

我问的是实验条件,你并没有回答实验条件如何。不说实验条件,别人就无从知道你的计算到底和实验有没有可比性
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dakedidi    时间: 2020-7-10 10:32
本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-11 12:47 编辑
sobereva 发表于 2020-7-10 05:30
我问的是实验条件,你并没有回答实验条件如何。不说实验条件,别人就无从知道你的计算到底和实验有没有可 ...

感谢sob老师!我用以模拟是一种固体凝凝胶,我是在常温下采用溴化钾压片法透射方式测试的红外。
作者
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sobereva    时间: 2020-7-11 12:24
dakedidi 发表于 2020-7-10 10:32
感谢sob老师!我用以模拟的材料是由沥青和一种液体分子共混的制备而成的。该材料常温下是固体凝凝胶,类 ...

做非谐振计算试试
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dakedidi    时间: 2020-7-12 10:52
sobereva 发表于 2020-7-11 12:24
做非谐振计算试试

感谢sob老师!我查询了资料,还是太搞清楚非谐振计算原理,请问sob老师非谐振计算结果可靠吗?用于结构优化么还,还是为了单独进行频率分析?对应高斯中的那个关键词?再次感谢!!!
作者
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sobereva    时间: 2020-7-13 10:33
dakedidi 发表于 2020-7-12 10:52
感谢sob老师!我查询了资料,还是太搞清楚非谐振计算原理,请问sob老师非谐振计算结果可靠吗?用于结构优 ...

非谐振是更高级的振动问题的处理方法,原理上显然比谐振可靠
基于之前优化的结构用freq=anharm。此计算非常耗时

非谐振光谱的计算和绘制这里提了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

更多信息公社首页google框搜论坛,之前我也回答过很多相关问题

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dakedidi    时间: 2020-7-13 17:15
sobereva 发表于 2020-7-13 10:33
非谐振是更高级的振动问题的处理方法,原理上显然比谐振可靠
基于之前优化的结构用freq=anharm。此计算 ...

收到sob老师,我研究一下,感谢!




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