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标题: CP2K计算中DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组的问题 [打印本页]

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Author: CCCC 时间: 2020-7-11 20:21
标题: CP2K计算中DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组的问题
我在CP2K的优化文件中看到了这样的基组，BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH，泛函是B3LYP，请问这是不是对应B3LYP/6-31G(d,p)？

作者
Author: wth1219 时间: 2020-7-11 22:32
MOLOPT是CP2K的特制基组，一般与GTH赝势联用。DZVP基组的精度相当于6-31G*（据https://www.cp2k.org/_media/even ... ng_basis_pseudo.pdf）。

作者
Author: CCCC 时间: 2020-7-12 16:33

wth1219 发表于 2020-7-11 22:32
MOLOPT是CP2K的特制基组，一般与GTH赝势联用。DZVP基组的精度相当于6-31G*（据https://www.cp2k.org/_media ...

谢谢回复~

作者
Author: tuzhidingdong 时间: 2020-10-9 23:50
从EMSL Basis Set中可能会找到一些熟悉的基组，例如6-31G(d,p)等，另外可以从https://www.basissetexchange.org/找到cp2k格式的基组文件。

作者
Author: haibeih 时间: 2020-10-10 08:25
用推荐的基组就好呀~
https://www.cp2k.org/exercises:2018_uzh_cmest:faq

作者
Author: elpa 时间: 2020-11-29 20:23

wth1219 发表于 2020-7-11 22:32
MOLOPT是CP2K的特制基组，一般与GTH赝势联用。DZVP基组的精度相当于6-31G*（据https://www.cp2k.org/_media ...

MOLOPT是CP2K的特制基组
请问BASIS_MOLOPT适用于哪些体系？

作者
Author: wth1219 时间: 2020-12-2 14:35

elpa 发表于 2020-11-29 20:23
MOLOPT是CP2K的特制基组
请问BASIS_MOLOPT适用于哪些体系？

您好。仅就本人对于CP2K的了解以及浏览过的文献来看，MOLOPT基组的使用没有体系限制。但孤立体系是很少使用CP2K计算的。

作者
Author: elpa 时间: 2020-12-9 23:33

wth1219 发表于 2020-12-2 14:35
您好。仅就本人对于CP2K的了解以及浏览过的文献来看，MOLOPT基组的使用没有体系限制。但孤立体系是很少使 ...

谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-15 05:19
MOLOPT与一般的量化领域的基组有极大的差异。DZVP-MOLOPT-SR-GTH与6-31(d,p)虽然表面上看都是带极化函数的2-zeta基组，但有极大不同，体现在
(1)MOLOPT系列都是和GTH赝势结合使用的赝势基组
(2)MOLOPT系列都是完全广义收缩基组，而6-31G(d,p)是片段收缩。这导致基于前者在没有特意考虑广义收缩的程序里做计算，比如在Multiwfn中做波函数分析，耗时会高非常非常多
(3)DZVP-MOLOPT-GTH是带有指数很小的高度弥散的高斯函数的，带SR（short-range）的DZVP-MOLOPT-SR-GTH虽然没有了指数那么小的高斯函数，但仍然有半弥散程度的函数，这是6-31G(d,p)不具备的。DZVP-MOLOPT-SR-GTH的最外层的GTF的指数比6-311G**的还要小。
(4)由于上述(3)的特征，DZVP-MOLOPT-SR-GTH，特别是DZVP-MOLOPT-GTH，在算需要弥散函数的偶极矩计算问题上明显好于6-31G(d,p)，BSSE问题也小得多得多。非要更贴切地对比，DZVP-MOLOPT-GTH应该和6-31+G(d,p)比。

CP2K里做GPW计算基本上能用MOLOPT都建议用MOLOPT，支持的元素比较全，气相和凝聚相都适用。一般用SR版就可以。如果对偶极矩、弱相互作用问题比较重视，用更贵的不带SR的。

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Author: k64_cc 时间: 2021-2-15 10:58
标题: （）
本帖最后由 k64_cc 于 2021-2-15 11:00 编辑

DZVP-MOLOPT系列是他们用小分子特别tune过的，在分子体系中达到了很高的精度，但是算起来很慢，特别慢，非常慢（原文献里也稍微提了一下这事）

SR的弥散函数没那么夸张，运算起来快多了，平均下来耗时比DZVP贵一小小点，但是精度比DZVP要好。对于凝聚相体系来说加大弥散本来就没什么必要，平常用SR就行。

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-2-15 14:50
本帖最后由卡开发发于 2021-2-15 14:51 编辑

哪怕是凝聚相或者表面，BSSE的问题还是需要小心的，可以参看（DOI: 10.1021/acs.jpcc.9b03554），需要注意的是有些结果看上去比较好看可能得益于误差抵消。

作者
Author: nusiew 时间: 2021-7-4 18:40
由于DZVP-MOLOPT-GTH基组仅涵盖H , C , N , O , F , Si , P , S , Cl元素，而DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组覆盖了元素周期表绝大部分元素，
请问计算同一个体系中DZVP-MOLOPT-GTH基组和DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组可以混用吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-18 02:35

nusiew 发表于 2021-7-4 18:40
由于DZVP-MOLOPT-GTH基组仅涵盖H , C , N , O , F , Si , P , S , Cl元素，而DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组覆盖了 ...

没特殊情况就都用DZVP-MOLOPT-SR-GTH
对弥散函数要求比较高的时候才适合特意花更高代价用不带SR的

作者
Author: xxq星球 时间: 2021-7-22 19:53

sobereva 发表于 2021-7-18 02:35
没特殊情况就都用DZVP-MOLOPT-SR-GTH
对弥散函数要求比较高的时候才适合特意花更高代价用不带SR的

一个体系内DZVP-MOLOPT-SR-GTH和TZVP-MOLOPT-SR-GTH可以混用吗？

作者
Author: 丁越 时间: 2021-7-22 22:28

xxq星球发表于 2021-7-22 19:53
一个体系内DZVP-MOLOPT-SR-GTH和TZVP-MOLOPT-SR-GTH可以混用吗？

可以，这就是混合基组

作者
Author: xxq星球 时间: 2021-7-23 10:21

丁越发表于 2021-7-22 22:28
可以，这就是混合基组

谢谢！

作者
Author: zhaoxiaoni 时间: 2023-1-4 17:17

丁越发表于 2021-7-22 22:28
可以，这就是混合基组

这两个基组在精度上差别大吗

作者
Author: 丁越 时间: 2023-1-4 18:29

zhaoxiaoni 发表于 2023-1-4 17:17
这两个基组在精度上差别大吗

一个是2-zeta基组，另一个是3-zeta基组，肯定是后者精度高，相应很耗时。

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