计算化学公社

标题: 求助VOTCA软件的安装编译 [打印本页]

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胖鱼加加    时间: 2020-7-15 17:09
标题: 求助VOTCA软件的安装编译
各位老师好!

本人最近看到一款软件,很是感兴趣,名为VOTCA,开源软件,看简介可以进行粗粒化模拟,还能算电荷传输和激子传输。但是安装中发现安装过程太复杂了,需要编译,我这个小白搞不定了。
以下为软件官网 http://www.votca.org/
各位老师谁能编译和使用此软件,请教教我,不胜感激!



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sobereva    时间: 2020-7-15 19:56
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“VOTCA软件”改了,以后务必注意,下次将扣分处理。
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njfuzjs    时间: 2020-7-15 21:56
https://github.com/votca/votca/blob/master/share/doc/INSTALL.rst
这不就是安装方法吗?
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胖鱼加加    时间: 2020-7-16 08:32
njfuzjs 发表于 2020-7-15 21:56
https://github.com/votca/votca/blob/master/share/doc/INSTALL.rst
这不就是安装方法吗?

我是按照这个方法安装的,但是前期的cmake编译器的安装和依赖库的安装对我这个新手来说有点难,总会报错,一个错误就要花大量时间来解决。
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naoki    时间: 2020-7-16 09:43
胖鱼加加 发表于 2020-7-16 08:32
我是按照这个方法安装的,但是前期的cmake编译器的安装和依赖库的安装对我这个新手来说有点难,总会报错 ...

系统自带的cmake应该可以直接用吧
参考http://sobereva.com/457
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@Bruce    时间: 2020-7-21 21:17
照着github的官方安装方法(3L给的网址),用Ubuntu系统(尝试过CentOS,似乎不行),一行命令安装完所有依赖包。
cmake安装3.12就行了,sobereva老师的gromacs安装教程里就有安装方法(楼上给的网址),百度一搜也一大堆。
安装完VOTCA的依赖包,后面照着github的输命令就可以了
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zjxitcc    时间: 2020-7-21 21:27
CMakeLists.txt文件里第一行就写得很清楚cmake_minimum_required(VERSION 3.10)
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胖鱼加加    时间: 2020-10-13 10:48
本帖最后由 胖鱼加加 于 2020-10-13 11:01 编辑
@Bruce 发表于 2020-7-21 21:17
照着github的官方安装方法(3L给的网址),用Ubuntu系统(尝试过CentOS,似乎不行),一行命令安装完所有依 ...

前辈,我按照你说的方式安装好了VOTCA-XTP,但是没有使用说明书,想尝试这运行里面的例子./run.sh,报错
xtp_run: command not found
是因为没有设置环境变量吗?安装说明中没有讲如何设置环境变量,请问前辈是否有遇到过此问题?还是我的思路不对?
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胖鱼加加    时间: 2020-10-13 17:21
@Bruce 发表于 2020-7-21 21:17
照着github的官方安装方法(3L给的网址),用Ubuntu系统(尝试过CentOS,似乎不行),一行命令安装完所有依 ...

前辈,VOTCA环境变量的问题我自己捣鼓明白了,现在开始尝试进行算例的运算 xtp-tutorials/GROMACS/Methane遇到了新的问题就是输出文件报错,具体out信息见附件,我觉得最应该解决的两个问题是以下两个
terminate called after throwing an instance of 'std::runtime_error'
  what():  VOTCASHARE not set, cannot open help files.但是不知道如何解决,还望高人指点,感激不尽。



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麦克列    时间: 2021-4-27 22:20
你好,我按照网站上的教程在centos上安装了,显示安装成功了,但是找不到安装在哪,您现在还做这个吗?能不能交流一下?

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sobereva    时间: 2021-5-3 02:59
麦克列 发表于 2021-4-27 22:20
你好,我按照网站上的教程在centos上安装了,显示安装成功了,但是找不到安装在哪,您现在还做这个吗?能不 ...

大多数程序没指定安装路径的话都会装到/usr/local/bin下面。对/usr包括子目录搜搜便知




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