计算化学公社

标题: 高斯进行柔性扫描和单独做限制性优化的区别? [打印本页]

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JoeyssaWang    时间: 2020-7-16 10:59
标题: 高斯进行柔性扫描和单独做限制性优化的区别?
用Gaussian做柔性扫描和单独做限制性优化opt+freq的区别是什么?
(1)柔性扫描的方法:关键词opt=modredundant
(2)限制性优化:取出柔性扫描的一个结构,单独做opt+freq,是用0/-1的方法限制原子坐标
问题1:这两者计算的力常数不同,做freq得到的力常数应该是对Hessian矩阵做对角化得到,那柔性扫描的力常数是怎么得到的呢?
问题2:这么做限制性优化,opt+freq得到的热力学参数是否准确?

感谢回复!




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zjxitcc    时间: 2020-7-16 11:08
问题中有矛盾点和歧义点。
(1)“单独做限制性优化”含义模糊,说清楚到底用的哪种技巧做的限制性优化,技巧有很多,还有-1/0冻结坐标的这种也可叫限制性优化;
(2)力常数 与 限制性优化 是两个问题,单独做限制性优化、不做freq计算并没有力常数。另外,通常应该去掉坐标限制再做freq计算(除非你就是想要带坐标限制的力常数)
作者
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JoeyssaWang    时间: 2020-7-16 11:17
zjxitcc 发表于 2020-7-16 11:08
问题中有矛盾点和歧义点。
(1)“单独做限制性优化”含义模糊,说清楚到底用的哪种技巧做的限制性优化, ...

不好意思,我准确说一下问题:
(1)单独做限制性优化,就是用 0 -1的方法限制的原子;
(2)单独做限制性优化时,同时做的opt+freq, 我需要的是在限制坐标下的力常数
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sobereva    时间: 2020-7-16 18:30
“柔性扫描的力常数”这描述完全是莫名其妙,柔性扫描和振动分析又没直接关系

做opt freq的时候,如果冻结了某些变量,则freq时Hessian矩阵中相应的矩阵元会被清零。

限制性优化显然之后做freq得到的热力学量在原理上不准确,除非你限制的是与你研究的问题无关的区域。

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JoeyssaWang    时间: 2020-7-16 19:52
本帖最后由 JoeyssaWang 于 2020-7-16 20:04 编辑
sobereva 发表于 2020-7-16 18:30
“柔性扫描的力常数”这描述完全是莫名其妙,柔性扫描和振动分析又没直接关系

做opt freq的时候,如果冻 ...

谢谢老师回复,我确实搞错了,我其实看的是柔性扫描过程,每一个原子的受力,就是输出文件里面Forces (Hartrees/Bohr)下面的坐标参数,我误当成了“力常数”。和振动分析得到的力常数搞混了,不好意思。
柔性扫描过程中(拉伸两个原子的距离),每一步scf都有Forces (Hartrees/Bohr),这时所限制的原子受力就不为零,其他原子为零,这该怎么理解呢?是不是只有在第一个出发点的时候时极小点,这时的E对R的一阶导数为零,然后偏移了这个位置就都不为零了。
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sobereva    时间: 2020-7-17 09:52
JoeyssaWang 发表于 2020-7-16 19:52
谢谢老师回复,我确实搞错了,我其实看的是柔性扫描过程,每一个原子的受力,就是输出文件里面Forces (Ha ...






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