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标题: 单茂配合物过渡态中,茂环的旋转问题 [打印本页]

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双黄蛋    时间: 2020-7-17 13:10
标题: 单茂配合物过渡态中,茂环的旋转问题
本帖最后由 双黄蛋 于 2020-7-18 00:08 编辑

寻找烯烃配位到单茂金属配合物上的过渡态,由于茂环不是对称的,环戊二烯上取代了四个甲基和一个三甲基硅基,我在寻找过渡态时,发现茂环并没有沿着茂环中点与中心金属的连线转动,尽管这样找出来的过渡态的振动方向和IRC都符合预期。除此之外,我还研究茚和芴的配合物,且茚和芴上的一些位置也有取代基。本人已将out文件上传[由于文件大小限制不得不压缩后上传],优化了80多步,但没见茂环转动。
请问我该如何解决这一问题?如何确定茂环合适的位置?求解答,不胜感激。

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sobereva    时间: 2020-7-18 10:53
当前过渡态没问题。搞不懂你为什么执着于让茂环旋转
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双黄蛋    时间: 2020-7-18 16:32
本帖最后由 双黄蛋 于 2020-7-18 16:53 编辑
sobereva 发表于 2020-7-18 10:53
当前过渡态没问题。搞不懂你为什么执着于让茂环旋转

感谢老师的回复。是这样的老师,我需要确定当前过渡态位于能量最低点(或接近于最低点)。我要对比不同的茂环引发单体聚合时的自由能。假如茂环A由于旋转角度不当导致能量偏高且误差较大,而茂环B旋转角度合适导致能量在允许的误差范围内,导致没法对比。
当前这个茂环位阻不怎么大,旋转角度对能量的影响可能在误差范围内。而接下来我还需要研究茚和芴的配合物,且茚和芴都带有取代基,在这么大位阻下我就得考虑旋转的问题了。附:配体的图片,以及茚和芴配合物寻找过渡态后的out文件。

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sobereva    时间: 2020-7-19 12:49
双黄蛋 发表于 2020-7-18 16:32
感谢老师的回复。是这样的老师,我需要确定当前过渡态位于能量最低点(或接近于最低点)。我要对比不同的茂 ...

我现在太忙没时间仔细看。你可以找过渡态摆初猜的时候把茂环转成不同角度,分别优化过渡态,看哪种情况下算出来的势垒最低,没准哪种方式反应就是最接近现实情况的
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双黄蛋    时间: 2020-7-20 11:07
sobereva 发表于 2020-7-19 12:49
我现在太忙没时间仔细看。你可以找过渡态摆初猜的时候把茂环转成不同角度,分别优化过渡态,看哪种情况下 ...

谢谢老师。我后来又找到了一篇相近的文献,文献介绍的操作也是调整茂环角度尝试的。确实如老师所说,尝试几个角度。




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